More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1219 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  95.68 
 
 		 345 aa  666    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  93.66 
 
 		 345 aa  655    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  100 
 
 		 347 aa  693    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  88.82 
 
 		 347 aa  607  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  86.67 
 
 		 350 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  85.67 
 
 		 346 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  86.67 
 
 		 350 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  86.83 
 
 		 366 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  85.59 
 
 		 350 aa  596  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  86.55 
 
 		 345 aa  597  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  89.23 
 
 		 376 aa  593  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  85.59 
 
 		 347 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  86.67 
 
 		 359 aa  591  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  85.59 
 
 		 347 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  85.59 
 
 		 347 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  83.09 
 
 		 352 aa  588  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  84.96 
 
 		 347 aa  587  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  84.43 
 
 		 365 aa  584  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  85.38 
 
 		 350 aa  587  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  85.46 
 
 		 345 aa  585  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  84.8 
 
 		 350 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  85.71 
 
 		 378 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  86.01 
 
 		 348 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  82.6 
 
 		 367 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  83.23 
 
 		 368 aa  574  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  85.28 
 
 		 364 aa  574  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  83.84 
 
 		 352 aa  569  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  84.15 
 
 		 351 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  81.32 
 
 		 348 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  80.87 
 
 		 349 aa  566  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  81.58 
 
 		 351 aa  562  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  80.75 
 
 		 348 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  80.84 
 
 		 383 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3919  recA protein  83.04 
 
 		 344 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  76.44 
 
 		 418 aa  532  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  74.03 
 
 		 379 aa  524  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  73.31 
 
 		 348 aa  488  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  69.23 
 
 		 346 aa  489  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  69.72 
 
 		 350 aa  486  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  68.13 
 
 		 348 aa  484  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  69.02 
 
 		 347 aa  485  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  70.3 
 
 		 362 aa  482  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  69.37 
 
 		 364 aa  482  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  68.18 
 
 		 358 aa  483  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  70 
 
 		 363 aa  480  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  68.25 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  69.91 
 
 		 344 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  68.1 
 
 		 390 aa  479  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  65.01 
 
 		 347 aa  477  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  67.89 
 
 		 355 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  69.02 
 
 		 347 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  69.02 
 
 		 343 aa  475  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  65.01 
 
 		 347 aa  477  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  68.81 
 
 		 343 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  66.97 
 
 		 347 aa  475  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  68.6 
 
 		 336 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  69 
 
 		 358 aa  472  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  67.87 
 
 		 354 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  67.87 
 
 		 354 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  69.75 
 
 		 342 aa  471  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  67.27 
 
 		 341 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  70.25 
 
 		 379 aa  472  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  66.96 
 
 		 360 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  67.07 
 
 		 352 aa  471  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  67.18 
 
 		 341 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  68.39 
 
 		 346 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  68.73 
 
 		 355 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  67.06 
 
 		 347 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  68.4 
 
 		 364 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  68.73 
 
 		 355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  66.87 
 
 		 361 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  71.25 
 
 		 345 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  68.73 
 
 		 355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  66.87 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  69.35 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  69.09 
 
 		 351 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  68.32 
 
 		 360 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  68.1 
 
 		 362 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  67.07 
 
 		 352 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  71.25 
 
 		 345 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  68.73 
 
 		 355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  68.62 
 
 		 359 aa  468  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  68.47 
 
 		 349 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  65.35 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  67.88 
 
 		 344 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  67.9 
 
 		 348 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  67.9 
 
 		 348 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1655  recombinase A  70.76 
 
 		 354 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.384834  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  67.79 
 
 		 361 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  66.96 
 
 		 356 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  69.28 
 
 		 358 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  68.32 
 
 		 348 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  66.56 
 
 		 361 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  65.8 
 
 		 363 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  65.9 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  67.8 
 
 		 349 aa  464  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  64.16 
 
 		 362 aa  464  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  69.44 
 
 		 346 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  66.47 
 
 		 361 aa  467  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  65.31 
 
 		 346 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>