More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3161 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  100 
 
 
336 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  87.35 
 
 
340 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  84.66 
 
 
338 aa  569  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  84.66 
 
 
338 aa  569  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  85.42 
 
 
339 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  84.5 
 
 
333 aa  554  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  81.99 
 
 
341 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  85.76 
 
 
338 aa  548  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  77.71 
 
 
358 aa  524  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  73.84 
 
 
358 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  76.78 
 
 
358 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  77.09 
 
 
358 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  76.34 
 
 
366 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  71.56 
 
 
379 aa  502  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  73.98 
 
 
347 aa  501  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  76.04 
 
 
365 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  72.05 
 
 
361 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  71.82 
 
 
343 aa  494  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  72.05 
 
 
424 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  71.74 
 
 
352 aa  494  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  71.74 
 
 
352 aa  494  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  72.92 
 
 
358 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  71.74 
 
 
362 aa  491  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  72.96 
 
 
362 aa  491  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  71.74 
 
 
361 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  73.07 
 
 
358 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  72.59 
 
 
361 aa  491  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  72.41 
 
 
360 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  70.87 
 
 
348 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  71.21 
 
 
384 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  71.88 
 
 
361 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  72.19 
 
 
343 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  72.36 
 
 
347 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  72.64 
 
 
363 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  72.36 
 
 
364 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  72.33 
 
 
356 aa  488  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  72.33 
 
 
363 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  71.43 
 
 
363 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  74.38 
 
 
359 aa  491  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  72.67 
 
 
362 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  71.12 
 
 
350 aa  490  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  73.07 
 
 
358 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  73.07 
 
 
358 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  69.46 
 
 
343 aa  487  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  71.52 
 
 
357 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  71.12 
 
 
355 aa  485  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  70.62 
 
 
348 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  70.62 
 
 
348 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  72.24 
 
 
362 aa  485  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  71.47 
 
 
342 aa  485  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  72.64 
 
 
357 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  67.57 
 
 
347 aa  484  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  69.88 
 
 
347 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  72.24 
 
 
362 aa  484  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  69.46 
 
 
343 aa  487  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  71.83 
 
 
359 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  71.83 
 
 
359 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  70.99 
 
 
343 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  70.9 
 
 
356 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  70.9 
 
 
356 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  71.21 
 
 
359 aa  482  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  71.74 
 
 
347 aa  483  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  70.9 
 
 
356 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  70.68 
 
 
368 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  73.91 
 
 
363 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  70.9 
 
 
356 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  69.57 
 
 
363 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  71.21 
 
 
348 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  70.9 
 
 
356 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  71.52 
 
 
356 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  70.5 
 
 
364 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  71.12 
 
 
345 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  68.54 
 
 
357 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  70.81 
 
 
364 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  70.9 
 
 
356 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  71.21 
 
 
356 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  70.68 
 
 
341 aa  482  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  71.43 
 
 
364 aa  481  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  71.21 
 
 
356 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  70.19 
 
 
378 aa  481  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  70.9 
 
 
356 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  70 
 
 
345 aa  481  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  71.21 
 
 
356 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  71.12 
 
 
365 aa  479  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  70.43 
 
 
358 aa  478  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  69.25 
 
 
362 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  70.92 
 
 
366 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  68.58 
 
 
365 aa  478  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  70.92 
 
 
366 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  70.06 
 
 
350 aa  478  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  70.85 
 
 
345 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  71.73 
 
 
343 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  72.53 
 
 
349 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  69.88 
 
 
360 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  75.16 
 
 
346 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  71.03 
 
 
364 aa  480  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  70.85 
 
 
345 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  70.5 
 
 
343 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  69.75 
 
 
348 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  72.58 
 
 
377 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>