More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10530 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  100 
 
 		 368 aa  738    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  87.12 
 
 		 350 aa  588  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  86.32 
 
 		 376 aa  586  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  83.57 
 
 		 346 aa  586  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  86.63 
 
 		 359 aa  586  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  85.23 
 
 		 364 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  80.23 
 
 		 347 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  81.6 
 
 		 345 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  83.89 
 
 		 366 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  83.54 
 
 		 345 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  81.79 
 
 		 345 aa  571  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  80.47 
 
 		 347 aa  568  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  82.35 
 
 		 351 aa  570  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  79.94 
 
 		 367 aa  570  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  78.9 
 
 		 351 aa  568  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  79.12 
 
 		 352 aa  564  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  78.55 
 
 		 345 aa  564  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  78.22 
 
 		 350 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  79.94 
 
 		 350 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  80.24 
 
 		 350 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  80.85 
 
 		 365 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  81.4 
 
 		 378 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  81.4 
 
 		 347 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  80.85 
 
 		 350 aa  558  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  81.4 
 
 		 347 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  81.4 
 
 		 347 aa  558  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  79.94 
 
 		 347 aa  556  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  84.94 
 
 		 348 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  80.55 
 
 		 348 aa  551  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  80.24 
 
 		 348 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  80.24 
 
 		 352 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  78.7 
 
 		 418 aa  535  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  77.91 
 
 		 349 aa  532  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  72.86 
 
 		 379 aa  533  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  76.69 
 
 		 383 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3919  recA protein  78.12 
 
 		 344 aa  518  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  67.85 
 
 		 364 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  73.37 
 
 		 344 aa  489  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  69.25 
 
 		 347 aa  484  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  70.68 
 
 		 336 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  69.54 
 
 		 350 aa  481  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  67.55 
 
 		 346 aa  479  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  67.85 
 
 		 341 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  70 
 
 		 343 aa  478  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  66.77 
 
 		 341 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  67.45 
 
 		 424 aa  475  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  70.95 
 
 		 379 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  70.9 
 
 		 346 aa  474  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  67.54 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  70.28 
 
 		 338 aa  474  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  69.06 
 
 		 390 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  67.45 
 
 		 361 aa  474  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  70.28 
 
 		 338 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  68.31 
 
 		 358 aa  471  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  66.56 
 
 		 347 aa  471  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  68.67 
 
 		 348 aa  474  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  65.62 
 
 		 348 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  70.54 
 
 		 338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  67.17 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  69.75 
 
 		 356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  69.33 
 
 		 360 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  67.19 
 
 		 352 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  67.19 
 
 		 352 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  68.67 
 
 		 355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  69.33 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  69.02 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  63.94 
 
 		 363 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  70.22 
 
 		 358 aa  467  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  73.21 
 
 		 333 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  67.19 
 
 		 343 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  68.81 
 
 		 357 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  66.15 
 
 		 347 aa  464  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  68.85 
 
 		 348 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  66.57 
 
 		 348 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  65.8 
 
 		 346 aa  465  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  66.15 
 
 		 347 aa  464  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  65.79 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  68.56 
 
 		 342 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  64.39 
 
 		 347 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  67.54 
 
 		 345 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  64.23 
 
 		 363 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  66.77 
 
 		 361 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  69.59 
 
 		 360 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  67.46 
 
 		 343 aa  467  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  65.61 
 
 		 361 aa  468  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  67.54 
 
 		 345 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  69.02 
 
 		 355 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  67.48 
 
 		 363 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  64.55 
 
 		 362 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  68.75 
 
 		 339 aa  461  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  68.97 
 
 		 349 aa  461  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  63.2 
 
 		 364 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  66.88 
 
 		 357 aa  463  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  63.94 
 
 		 363 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  69.06 
 
 		 357 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  67.48 
 
 		 362 aa  461  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  65.78 
 
 		 348 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  68.52 
 
 		 343 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  65.01 
 
 		 362 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  68.5 
 
 		 345 aa  459  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>