More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1345 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  100 
 
 
347 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  94.84 
 
 
349 aa  646    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  100 
 
 
347 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  77.22 
 
 
343 aa  502  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  76.45 
 
 
343 aa  501  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  76.18 
 
 
343 aa  501  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  75.95 
 
 
343 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  77.45 
 
 
343 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  74.78 
 
 
343 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  69.35 
 
 
362 aa  489  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  68.69 
 
 
343 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  69.63 
 
 
347 aa  482  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  70.55 
 
 
355 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  69.23 
 
 
345 aa  481  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  67.48 
 
 
365 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  67.85 
 
 
364 aa  478  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  67.69 
 
 
352 aa  478  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  65.01 
 
 
347 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  66.56 
 
 
345 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  64.52 
 
 
350 aa  477  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  67.48 
 
 
366 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  67.38 
 
 
367 aa  477  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  65.85 
 
 
364 aa  471  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  68.71 
 
 
346 aa  472  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  72.27 
 
 
349 aa  472  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  68.92 
 
 
347 aa  472  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  65.48 
 
 
341 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  66.46 
 
 
344 aa  473  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  66.47 
 
 
345 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  66.86 
 
 
364 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  64.71 
 
 
376 aa  472  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  69.33 
 
 
385 aa  473  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  66.87 
 
 
357 aa  472  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  66.77 
 
 
345 aa  471  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  64.06 
 
 
350 aa  472  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  64.29 
 
 
350 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  65.54 
 
 
359 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  67.18 
 
 
348 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  66.57 
 
 
363 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  66.77 
 
 
347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  61.27 
 
 
379 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  67.18 
 
 
348 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  68.2 
 
 
348 aa  471  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  65.36 
 
 
358 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  66.77 
 
 
347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  65.38 
 
 
347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  66.46 
 
 
378 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  66.56 
 
 
347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  66.77 
 
 
347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  66.77 
 
 
352 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  66.77 
 
 
352 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  67.48 
 
 
347 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  65.28 
 
 
346 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  66.46 
 
 
350 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  65.54 
 
 
376 aa  465  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  65.54 
 
 
379 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  67.08 
 
 
350 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  64.33 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  65.36 
 
 
362 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  65.95 
 
 
348 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  65.79 
 
 
348 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  66.15 
 
 
368 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  62.65 
 
 
352 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  64.53 
 
 
349 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  66.57 
 
 
348 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  65.85 
 
 
346 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  64.72 
 
 
383 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  64.53 
 
 
348 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  64.53 
 
 
348 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  65.34 
 
 
424 aa  457  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  64.12 
 
 
342 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  65.14 
 
 
347 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  64.12 
 
 
347 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  65.54 
 
 
350 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  61.65 
 
 
351 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  63.72 
 
 
418 aa  459  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  65.34 
 
 
361 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  63.31 
 
 
351 aa  456  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  64.83 
 
 
341 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  65.64 
 
 
354 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  66.67 
 
 
345 aa  455  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  64.72 
 
 
361 aa  454  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  66.67 
 
 
345 aa  455  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  65.33 
 
 
336 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  64.47 
 
 
379 aa  456  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  66.87 
 
 
379 aa  451  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  65.03 
 
 
364 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  65.03 
 
 
362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  65.34 
 
 
362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  64.74 
 
 
364 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  66.15 
 
 
356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  63.53 
 
 
335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  63.64 
 
 
358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  64.2 
 
 
360 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03513  recombinase A  63.4 
 
 
354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  63.83 
 
 
390 aa  454  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1655  recombinase A  65.79 
 
 
354 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.384834  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  61 
 
 
354 aa  449  1e-125  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  63.55 
 
 
358 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  63.96 
 
 
357 aa  448  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>