More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1645 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  99.43 
 
 		 352 aa  710    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  100 
 
 		 352 aa  712    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  72.64 
 
 		 341 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  74.15 
 
 		 347 aa  517  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  73.31 
 
 		 364 aa  504  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  72.39 
 
 		 341 aa  501  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  75.62 
 
 		 349 aa  502  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  73.37 
 
 		 343 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  69.37 
 
 		 347 aa  501  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  74.53 
 
 		 356 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  74.06 
 
 		 360 aa  500  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  74.4 
 
 		 346 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  70.21 
 
 		 355 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  71.6 
 
 		 338 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  71.17 
 
 		 366 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  72 
 
 		 357 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  71.47 
 
 		 361 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  70.86 
 
 		 348 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  71.47 
 
 		 424 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  71.74 
 
 		 336 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  71.6 
 
 		 338 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  68.01 
 
 		 361 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  69.55 
 
 		 358 aa  488  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  70.81 
 
 		 350 aa  488  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  68.29 
 
 		 390 aa  490  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  66.86 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  69.85 
 
 		 345 aa  485  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  71.47 
 
 		 343 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  67.54 
 
 		 343 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  66.47 
 
 		 361 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  67.98 
 
 		 347 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  67.35 
 
 		 362 aa  481  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  65.77 
 
 		 378 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  65.09 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  67.65 
 
 		 362 aa  481  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  66.76 
 
 		 357 aa  482  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  70.03 
 
 		 358 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  67.38 
 
 		 364 aa  478  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  66.67 
 
 		 347 aa  479  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  68.52 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  68.52 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  66.77 
 
 		 383 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  67.38 
 
 		 357 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  67.4 
 
 		 344 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  69.54 
 
 		 359 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  68.42 
 
 		 362 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  66.38 
 
 		 358 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  66.38 
 
 		 358 aa  474  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  69.33 
 
 		 362 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  69.02 
 
 		 364 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  67.76 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  67.7 
 
 		 348 aa  474  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  67.25 
 
 		 363 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  67.54 
 
 		 363 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  66.96 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  69.02 
 
 		 357 aa  477  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  67.39 
 
 		 346 aa  474  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  66.77 
 
 		 350 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  67.53 
 
 		 363 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  68.01 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  67.38 
 
 		 350 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  67.37 
 
 		 356 aa  474  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  71.02 
 
 		 365 aa  471  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  67.37 
 
 		 347 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  64.84 
 
 		 352 aa  473  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  67.07 
 
 		 347 aa  471  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  65.13 
 
 		 348 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  69.51 
 
 		 339 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1920  recA protein  72.31 
 
 		 347 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000130185  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  66.67 
 
 		 364 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  67.89 
 
 		 347 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  68.42 
 
 		 363 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  65.96 
 
 		 361 aa  474  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  67.37 
 
 		 347 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  68.22 
 
 		 344 aa  472  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  67.08 
 
 		 346 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  69.57 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  65.59 
 
 		 345 aa  471  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  67.39 
 
 		 359 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  67.37 
 
 		 347 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  66.77 
 
 		 347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  66.77 
 
 		 355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  68.82 
 
 		 366 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  67.7 
 
 		 376 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  67.46 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  65.24 
 
 		 418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  65.52 
 
 		 358 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  65.5 
 
 		 345 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  67.38 
 
 		 347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  66.87 
 
 		 348 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  65.62 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  66.77 
 
 		 355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  67.19 
 
 		 368 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  66.77 
 
 		 355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  66.16 
 
 		 347 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  67.08 
 
 		 355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  68.24 
 
 		 366 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  66.67 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  66.77 
 
 		 347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  66.47 
 
 		 350 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>