More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0512 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  86.55 
 
 		 356 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  100 
 
 		 357 aa  715    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  82.91 
 
 		 360 aa  619  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  77.91 
 
 		 362 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  77.59 
 
 		 362 aa  555  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  77.26 
 
 		 366 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  77.62 
 
 		 364 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  76.97 
 
 		 350 aa  551  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  77.65 
 
 		 343 aa  552  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  77.78 
 
 		 343 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  77.33 
 
 		 363 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  76.45 
 
 		 363 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  76.61 
 
 		 361 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  76.16 
 
 		 363 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  74.08 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  76.52 
 
 		 361 aa  545  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  76.52 
 
 		 424 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  76.16 
 
 		 362 aa  546  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  75 
 
 		 362 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  73.88 
 
 		 355 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  74.35 
 
 		 361 aa  539  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  74.57 
 
 		 364 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  74.28 
 
 		 362 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  75.36 
 
 		 361 aa  537  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  76.9 
 
 		 366 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  76.9 
 
 		 366 aa  537  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  76.06 
 
 		 366 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  76.76 
 
 		 365 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  74.48 
 
 		 360 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  75.28 
 
 		 363 aa  527  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  76.97 
 
 		 363 aa  528  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  75.37 
 
 		 357 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  75 
 
 		 363 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  76.31 
 
 		 347 aa  524  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  75.08 
 
 		 357 aa  521  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  75.93 
 
 		 390 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  75.54 
 
 		 356 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1392  recombinase A  72.6 
 
 		 356 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  71.89 
 
 		 348 aa  504  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  71.89 
 
 		 348 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  71.88 
 
 		 348 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  73.12 
 
 		 346 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  73.12 
 
 		 346 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  72.81 
 
 		 349 aa  498  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  73.54 
 
 		 345 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  72.81 
 
 		 355 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  73.44 
 
 		 352 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  72 
 
 		 352 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  72 
 
 		 352 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  73.54 
 
 		 345 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  72.81 
 
 		 355 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  72.81 
 
 		 355 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  72.5 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  73.44 
 
 		 354 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  73.44 
 
 		 354 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  73.59 
 
 		 357 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  73.59 
 
 		 357 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  72.81 
 
 		 355 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2373  recombinase A  73.59 
 
 		 357 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  72.41 
 
 		 348 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  71.25 
 
 		 347 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  72.19 
 
 		 345 aa  488  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  73.52 
 
 		 342 aa  490  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  73.6 
 
 		 379 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  67.56 
 
 		 347 aa  488  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  71.88 
 
 		 355 aa  489  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  73.44 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  71.03 
 
 		 349 aa  485  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  73.68 
 
 		 355 aa  485  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  71.56 
 
 		 354 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  67.36 
 
 		 347 aa  484  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  72.64 
 
 		 336 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  71.21 
 
 		 358 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1476  recombinase A  72.67 
 
 		 345 aa  481  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158308  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  70.28 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  69.35 
 
 		 341 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  71.03 
 
 		 358 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03513  recombinase A  71.25 
 
 		 354 aa  481  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  70.21 
 
 		 362 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  72.45 
 
 		 359 aa  481  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  70.21 
 
 		 363 aa  480  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  71.97 
 
 		 338 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00149  recombinase A  71.43 
 
 		 344 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1215  recombinase A  66.47 
 
 		 353 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  69.47 
 
 		 327 aa  481  1e-134  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0570  recombinase A  69.41 
 
 		 344 aa  479  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.244041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  72.27 
 
 		 358 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  68.83 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0086  recombinase A  72.36 
 
 		 347 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  69.06 
 
 		 358 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  72.59 
 
 		 358 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002519  RecA protein  71.56 
 
 		 347 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  72.05 
 
 		 347 aa  478  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  71.97 
 
 		 338 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1483  recombinase A  74.84 
 
 		 347 aa  478  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  74.77 
 
 		 343 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  66.96 
 
 		 383 aa  478  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  66.47 
 
 		 357 aa  474  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  67.76 
 
 		 357 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1208  recombinase A  69.66 
 
 		 353 aa  474  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>