More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1050 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  100 
 
 		 349 aa  699    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  86.59 
 
 		 347 aa  597  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  78.42 
 
 		 341 aa  550  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  74.27 
 
 		 364 aa  532  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  76.4 
 
 		 348 aa  521  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  76.54 
 
 		 343 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  75.62 
 
 		 352 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  75.62 
 
 		 352 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  73.01 
 
 		 355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  76.88 
 
 		 356 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  73.23 
 
 		 347 aa  510  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  73.12 
 
 		 346 aa  501  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  72.9 
 
 		 357 aa  502  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  72.9 
 
 		 345 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  69.62 
 
 		 365 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  72.53 
 
 		 336 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  68.73 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  71.21 
 
 		 341 aa  495  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  74.38 
 
 		 345 aa  495  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  71.08 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  72.27 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  70.5 
 
 		 350 aa  492  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  72.27 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  67.18 
 
 		 346 aa  490  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  70.4 
 
 		 350 aa  488  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  66.96 
 
 		 350 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  69.38 
 
 		 367 aa  488  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  74.15 
 
 		 343 aa  488  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  67.35 
 
 		 347 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1920  recA protein  73.62 
 
 		 347 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000130185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  67.86 
 
 		 359 aa  489  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  69.88 
 
 		 376 aa  488  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  71.56 
 
 		 358 aa  488  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  71.52 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  70.37 
 
 		 344 aa  489  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  70.06 
 
 		 346 aa  489  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  68.11 
 
 		 418 aa  485  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  70.06 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  69.25 
 
 		 348 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  70.37 
 
 		 366 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  69.88 
 
 		 345 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  67.84 
 
 		 356 aa  486  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  70.06 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  69.57 
 
 		 348 aa  487  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  72.96 
 
 		 338 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  71.88 
 
 		 360 aa  486  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  72.96 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  70.06 
 
 		 424 aa  485  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  65.1 
 
 		 352 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  67.55 
 
 		 347 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  69.47 
 
 		 383 aa  484  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  64.74 
 
 		 379 aa  487  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  66.96 
 
 		 350 aa  484  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  69.28 
 
 		 364 aa  484  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  66.67 
 
 		 345 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  67.26 
 
 		 346 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  66.96 
 
 		 347 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  66.96 
 
 		 347 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  68.54 
 
 		 378 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  66.86 
 
 		 350 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  70.09 
 
 		 366 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  66.96 
 
 		 347 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  71.96 
 
 		 349 aa  480  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  69.88 
 
 		 358 aa  479  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  72.92 
 
 		 343 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  72.92 
 
 		 343 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  72.92 
 
 		 343 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  68.97 
 
 		 368 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  66.28 
 
 		 362 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  72.92 
 
 		 343 aa  480  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  70.06 
 
 		 364 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  68.67 
 
 		 348 aa  478  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  68.42 
 
 		 350 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  69.75 
 
 		 362 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  69.54 
 
 		 357 aa  478  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  72.92 
 
 		 343 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  69.38 
 
 		 347 aa  478  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  69.25 
 
 		 345 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  66.28 
 
 		 363 aa  478  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  65.29 
 
 		 343 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  69.16 
 
 		 349 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  68.83 
 
 		 361 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  64.86 
 
 		 362 aa  474  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  65.33 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  67.6 
 
 		 351 aa  476  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  64.04 
 
 		 347 aa  474  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  66.28 
 
 		 365 aa  476  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  68.21 
 
 		 360 aa  474  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  68.83 
 
 		 352 aa  476  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  69.35 
 
 		 359 aa  476  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  69.44 
 
 		 355 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  68.83 
 
 		 363 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  64.45 
 
 		 348 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  68.83 
 
 		 363 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  69.57 
 
 		 363 aa  474  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0981  recA protein  69.06 
 
 		 358 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1208  recombinase A  65.71 
 
 		 353 aa  471  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  65.52 
 
 		 363 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  68.83 
 
 		 362 aa  471  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  70.06 
 
 		 347 aa  472  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>