More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1619 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1619  recA protein  100 
 
 		 352 aa  709    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  81.3 
 
 		 352 aa  594  1e-169  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  79.94 
 
 		 361 aa  548  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  68.75 
 
 		 348 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  69.33 
 
 		 347 aa  481  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  69.02 
 
 		 364 aa  482  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  68.1 
 
 		 341 aa  474  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0779  recA protein  78.57 
 
 		 362 aa  472  1e-132  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000418573  normal  0.0314858 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  64.84 
 
 		 352 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  66.57 
 
 		 347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  66.26 
 
 		 347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  67.07 
 
 		 352 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  66.56 
 
 		 355 aa  466  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  67.39 
 
 		 357 aa  464  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  67.48 
 
 		 345 aa  461  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  67.18 
 
 		 352 aa  461  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  66.06 
 
 		 367 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  64.81 
 
 		 349 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  68.11 
 
 		 364 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  67.8 
 
 		 361 aa  457  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  67.8 
 
 		 362 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  66.36 
 
 		 350 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  64.91 
 
 		 345 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  66.46 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  68.83 
 
 		 349 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  67.18 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  67.8 
 
 		 424 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  65.5 
 
 		 347 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  67.8 
 
 		 361 aa  458  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  67.48 
 
 		 359 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  66.87 
 
 		 365 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  67.91 
 
 		 351 aa  454  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  63.77 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  65.14 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  62.15 
 
 		 353 aa  457  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  64.63 
 
 		 378 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  68.11 
 
 		 344 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  67.89 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  63.56 
 
 		 350 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  65.02 
 
 		 362 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  65.75 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  63.95 
 
 		 345 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  66.67 
 
 		 358 aa  453  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  64.83 
 
 		 358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  67.49 
 
 		 361 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  65.28 
 
 		 343 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  65.64 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  65.63 
 
 		 362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  66.06 
 
 		 348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  67.28 
 
 		 346 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  64.62 
 
 		 346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  69.9 
 
 		 368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  66.36 
 
 		 343 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  62.72 
 
 		 346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  65.75 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  65.64 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  65.74 
 
 		 348 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  65.75 
 
 		 359 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  65.75 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  66.98 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  67.18 
 
 		 345 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  65.75 
 
 		 359 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  65.64 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  66.26 
 
 		 350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  65.14 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  66.77 
 
 		 350 aa  448  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  65.14 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  63.27 
 
 		 351 aa  449  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  65.14 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  65.14 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  65.14 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  65.14 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  65.44 
 
 		 357 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  66.67 
 
 		 366 aa  448  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  62.97 
 
 		 356 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  66.56 
 
 		 364 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  62.46 
 
 		 358 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  63.29 
 
 		 363 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  64.71 
 
 		 362 aa  448  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  66.16 
 
 		 379 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  64.83 
 
 		 348 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  66.25 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  65.74 
 
 		 348 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  65.63 
 
 		 362 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  63.72 
 
 		 350 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  65.33 
 
 		 363 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  65.14 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  67.42 
 
 		 379 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  65.94 
 
 		 343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  63.91 
 
 		 358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  65.12 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  62.91 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  62.83 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  62.35 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  66.56 
 
 		 365 aa  444  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  66.56 
 
 		 366 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  64.71 
 
 		 355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  64.71 
 
 		 364 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  65.33 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  65.95 
 
 		 383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>