More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5453 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  88.95 
 
 		 362 aa  671    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  91.64 
 
 		 364 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  91.64 
 
 		 363 aa  682    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  91.97 
 
 		 363 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  90.3 
 
 		 363 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  89.78 
 
 		 362 aa  677    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  100 
 
 		 362 aa  731    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  82.91 
 
 		 361 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  80.33 
 
 		 362 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  80.17 
 
 		 364 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  80.39 
 
 		 361 aa  601  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  80.39 
 
 		 424 aa  601  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  79.01 
 
 		 355 aa  598  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  78.67 
 
 		 360 aa  598  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  80.56 
 
 		 361 aa  595  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  78.95 
 
 		 361 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  80.23 
 
 		 343 aa  588  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  80.35 
 
 		 362 aa  587  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  81.2 
 
 		 366 aa  578  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  80.63 
 
 		 366 aa  578  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  80.63 
 
 		 366 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  80.62 
 
 		 365 aa  578  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  80.46 
 
 		 363 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  80.17 
 
 		 363 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  80.39 
 
 		 363 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  74.65 
 
 		 366 aa  566  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  77.91 
 
 		 357 aa  558  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  75.72 
 
 		 347 aa  554  1e-157  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  75.63 
 
 		 359 aa  555  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  76.25 
 
 		 343 aa  548  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  75.63 
 
 		 356 aa  548  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  74.86 
 
 		 350 aa  550  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  78.14 
 
 		 360 aa  545  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  76.11 
 
 		 357 aa  540  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  74.56 
 
 		 356 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1392  recombinase A  74.79 
 
 		 356 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  75.61 
 
 		 357 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2373  recombinase A  77.37 
 
 		 357 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  72.73 
 
 		 390 aa  512  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  77.37 
 
 		 357 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  77.37 
 
 		 357 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  70.8 
 
 		 384 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  71 
 
 		 363 aa  501  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  72.9 
 
 		 345 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  70.69 
 
 		 362 aa  498  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  73.29 
 
 		 348 aa  499  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  72.5 
 
 		 345 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  69.45 
 
 		 358 aa  494  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  72.59 
 
 		 348 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  72.59 
 
 		 348 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  70.5 
 
 		 347 aa  495  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  72.5 
 
 		 345 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  71.12 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  71.17 
 
 		 345 aa  491  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  71.65 
 
 		 349 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  71.39 
 
 		 355 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  69.94 
 
 		 342 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  73.25 
 
 		 377 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  69.14 
 
 		 358 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  71.69 
 
 		 358 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  67.9 
 
 		 358 aa  491  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  68.39 
 
 		 356 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  72.96 
 
 		 336 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  68.1 
 
 		 356 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  68.1 
 
 		 356 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  68.1 
 
 		 356 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3138  recombinase A  70.5 
 
 		 353 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383703 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  68.1 
 
 		 356 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  68.1 
 
 		 356 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  69.7 
 
 		 348 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  68.1 
 
 		 356 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  68.1 
 
 		 356 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0981  recA protein  69.57 
 
 		 358 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3340  recombinase A  70.72 
 
 		 353 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  69.28 
 
 		 356 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  69.58 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  69.79 
 
 		 359 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2948  recombinase A  70.5 
 
 		 353 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  69.28 
 
 		 356 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1215  recombinase A  70.72 
 
 		 353 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3031  recombinase A  70.5 
 
 		 353 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00473022  hitchhiker  0.000967818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  70.5 
 
 		 353 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  70.5 
 
 		 353 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  70.4 
 
 		 349 aa  484  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  69.79 
 
 		 359 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3174  recombinase A  71.12 
 
 		 352 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0591186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  69.28 
 
 		 356 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  73.91 
 
 		 343 aa  484  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  71.65 
 
 		 358 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  69.88 
 
 		 353 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1300  recombinase A  70.72 
 
 		 353 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  69.57 
 
 		 357 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  69.88 
 
 		 353 aa  482  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  69.57 
 
 		 357 aa  481  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  67.91 
 
 		 358 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  69.88 
 
 		 353 aa  482  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1126  recombinase A  69.57 
 
 		 357 aa  481  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  70.15 
 
 		 347 aa  481  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1046  recombinase A  70.19 
 
 		 355 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.558521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  70.09 
 
 		 347 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>