More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1958 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1202  recombinase A  88.12 
 
 		 361 aa  655    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  88.58 
 
 		 361 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  91.16 
 
 		 361 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  100 
 
 		 362 aa  728    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  90.49 
 
 		 360 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  98.63 
 
 		 364 aa  719    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  90.99 
 
 		 362 aa  670    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  88.12 
 
 		 424 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  82.25 
 
 		 355 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  79.78 
 
 		 362 aa  604  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  80.39 
 
 		 362 aa  604  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  80.33 
 
 		 362 aa  604  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  84.21 
 
 		 343 aa  604  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  82.87 
 
 		 365 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  80.78 
 
 		 363 aa  597  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  80.85 
 
 		 363 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  81.21 
 
 		 361 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  80.85 
 
 		 364 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  80.85 
 
 		 363 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  83.72 
 
 		 347 aa  592  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  80.66 
 
 		 366 aa  585  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  81.77 
 
 		 363 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  82.17 
 
 		 363 aa  584  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  80.33 
 
 		 366 aa  585  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  80.66 
 
 		 366 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  81.89 
 
 		 363 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  78.77 
 
 		 366 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  77.29 
 
 		 359 aa  567  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  79.88 
 
 		 343 aa  551  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  77.74 
 
 		 350 aa  553  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  74.79 
 
 		 356 aa  543  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  75.73 
 
 		 357 aa  538  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  74.28 
 
 		 357 aa  535  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  77.04 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  73.52 
 
 		 360 aa  530  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  76.95 
 
 		 357 aa  527  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1392  recombinase A  73.6 
 
 		 356 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2373  recombinase A  76.7 
 
 		 357 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  76.7 
 
 		 357 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  76.7 
 
 		 357 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  75 
 
 		 390 aa  510  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  73.48 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  68.6 
 
 		 347 aa  504  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  76.11 
 
 		 377 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  74.34 
 
 		 355 aa  505  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  72.36 
 
 		 348 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  72.9 
 
 		 349 aa  501  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  73.68 
 
 		 342 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  73.21 
 
 		 345 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  73.37 
 
 		 345 aa  500  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  71 
 
 		 363 aa  499  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  73.37 
 
 		 345 aa  500  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  71.82 
 
 		 358 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  71.82 
 
 		 358 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  74.84 
 
 		 343 aa  500  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  72.12 
 
 		 358 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  74.84 
 
 		 343 aa  500  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  70.69 
 
 		 362 aa  498  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0497  recombinase A  72.87 
 
 		 353 aa  495  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00187604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  72.39 
 
 		 345 aa  497  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  72.27 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  72.27 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  71.52 
 
 		 356 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  73.91 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  71.82 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  71.95 
 
 		 356 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  71.52 
 
 		 356 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  71.52 
 
 		 356 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  71.82 
 
 		 357 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  71.52 
 
 		 356 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  71.52 
 
 		 356 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  71.52 
 
 		 356 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  71.52 
 
 		 356 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  69.63 
 
 		 353 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  71.52 
 
 		 356 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  71.52 
 
 		 356 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  69.63 
 
 		 353 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  71.52 
 
 		 356 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3340  recombinase A  72.59 
 
 		 353 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  71.76 
 
 		 384 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3138  recombinase A  69.63 
 
 		 353 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383703 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  71.43 
 
 		 359 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3031  recombinase A  69.63 
 
 		 353 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00473022  hitchhiker  0.000967818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2948  recombinase A  69.63 
 
 		 353 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  71.43 
 
 		 359 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02549  recombinase A  69.71 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  71.74 
 
 		 363 aa  488  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  69.71 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  69.71 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0355  recA protein  73.17 
 
 		 367 aa  488  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  72.56 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  72.48 
 
 		 358 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2983  recombinase A  69.71 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0313902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  69.71 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  72.87 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  71.83 
 
 		 358 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  72.67 
 
 		 336 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1215  recombinase A  71.96 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2835  recombinase A  69.71 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1300  recombinase A  72.27 
 
 		 353 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>