More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1263 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  87.78 
 
 		 361 aa  645    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  88.27 
 
 		 361 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  87.02 
 
 		 362 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  88.27 
 
 		 424 aa  647    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  87.6 
 
 		 364 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  100 
 
 		 360 aa  725    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  90.49 
 
 		 362 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  90.78 
 
 		 361 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  82.25 
 
 		 355 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  86.23 
 
 		 343 aa  601  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  78.65 
 
 		 362 aa  597  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  78.67 
 
 		 362 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  79.21 
 
 		 362 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  82.37 
 
 		 361 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  81.28 
 
 		 365 aa  592  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  80 
 
 		 363 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  79.15 
 
 		 363 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  83.67 
 
 		 363 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  84.73 
 
 		 347 aa  586  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  78.59 
 
 		 364 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  79.15 
 
 		 363 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  80.56 
 
 		 366 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  80.56 
 
 		 366 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  82.52 
 
 		 363 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  80.56 
 
 		 366 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  82.81 
 
 		 363 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  78.61 
 
 		 366 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  77.42 
 
 		 350 aa  555  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  79.57 
 
 		 343 aa  553  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  74.3 
 
 		 359 aa  547  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  75.28 
 
 		 356 aa  539  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  74.78 
 
 		 357 aa  536  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  75.95 
 
 		 356 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  74.48 
 
 		 357 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  75.59 
 
 		 357 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  72.19 
 
 		 360 aa  527  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2373  recombinase A  76.99 
 
 		 357 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  76.7 
 
 		 357 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  74.55 
 
 		 390 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  76.7 
 
 		 357 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1392  recombinase A  74.13 
 
 		 356 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  75.07 
 
 		 355 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  73.07 
 
 		 345 aa  498  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  73.37 
 
 		 342 aa  498  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  73.07 
 
 		 345 aa  498  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  69.88 
 
 		 347 aa  499  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  68.12 
 
 		 348 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  72.27 
 
 		 349 aa  495  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  71.17 
 
 		 362 aa  495  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  71.17 
 
 		 363 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  71.47 
 
 		 384 aa  495  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  72.98 
 
 		 348 aa  493  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  72.59 
 
 		 345 aa  491  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  71.56 
 
 		 348 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  71.56 
 
 		 348 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  72.39 
 
 		 356 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  71.65 
 
 		 358 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  72.26 
 
 		 358 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  71.34 
 
 		 358 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  73.29 
 
 		 343 aa  491  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  73.29 
 
 		 343 aa  491  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02549  recombinase A  72.36 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  71.17 
 
 		 345 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  71.34 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02514  hypothetical protein  72.36 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302057  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1300  recombinase A  71.96 
 
 		 353 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151962 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  71.34 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3340  recombinase A  71.96 
 
 		 353 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  71.34 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  71.34 
 
 		 363 aa  490  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  71.34 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  71.34 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  71.34 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  71.34 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  71.04 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3178  recombinase A  72.36 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0943419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  72.61 
 
 		 377 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  72.36 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  72.36 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2983  recombinase A  72.36 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0313902  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  71.04 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0981  recA protein  71.04 
 
 		 358 aa  488  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  71.56 
 
 		 359 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1195  recombinase A  71.34 
 
 		 355 aa  488  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  72.45 
 
 		 358 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  71.04 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  71.34 
 
 		 357 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2835  recombinase A  72.36 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246819  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  71.56 
 
 		 359 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  72.36 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  71.34 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0990  recA protein  72.05 
 
 		 353 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000616835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1215  recombinase A  71.03 
 
 		 353 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  72.05 
 
 		 353 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1208  recombinase A  71.12 
 
 		 353 aa  485  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3138  recombinase A  72.05 
 
 		 353 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  72.05 
 
 		 353 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1062  recombinase A  71.96 
 
 		 354 aa  486  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2948  recombinase A  72.05 
 
 		 353 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3174  recombinase A  71.04 
 
 		 352 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0591186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>