More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1165 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  88.12 
 
 
362 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  100 
 
 
424 aa  864    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  89.55 
 
 
364 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  88.92 
 
 
361 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  100 
 
 
361 aa  729    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  96.68 
 
 
361 aa  706    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  88.27 
 
 
360 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  88.64 
 
 
362 aa  654    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  83.94 
 
 
355 aa  615  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  85.13 
 
 
343 aa  608  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  82.12 
 
 
363 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  83.9 
 
 
365 aa  605  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  85.55 
 
 
347 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  80.39 
 
 
362 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  82.2 
 
 
363 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  80.11 
 
 
362 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  82.95 
 
 
361 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  79.94 
 
 
362 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  81.64 
 
 
363 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  81.36 
 
 
364 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  82.87 
 
 
363 aa  595  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  82.44 
 
 
363 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  79.94 
 
 
366 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  77.72 
 
 
366 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  79.94 
 
 
366 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  80.34 
 
 
366 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  82.15 
 
 
363 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  76.88 
 
 
359 aa  568  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  78.43 
 
 
350 aa  560  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  78.81 
 
 
343 aa  557  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  76.14 
 
 
356 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  76.52 
 
 
357 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  76.11 
 
 
357 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  74.58 
 
 
360 aa  544  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  78.35 
 
 
356 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  79.88 
 
 
357 aa  540  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  76.25 
 
 
355 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  76.06 
 
 
390 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1392  recombinase A  72.73 
 
 
356 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2373  recombinase A  75.81 
 
 
357 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  72.51 
 
 
363 aa  508  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  75.52 
 
 
357 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  75.52 
 
 
357 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  72.67 
 
 
348 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  71.9 
 
 
362 aa  504  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  72.59 
 
 
349 aa  502  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  68.31 
 
 
347 aa  504  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  69.77 
 
 
384 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  72.76 
 
 
358 aa  501  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  73.99 
 
 
345 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  73.99 
 
 
345 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  71.82 
 
 
356 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  71.82 
 
 
356 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  71.82 
 
 
356 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  73.21 
 
 
345 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  71.82 
 
 
356 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  71.82 
 
 
358 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  71.82 
 
 
356 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  71.82 
 
 
356 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  73.07 
 
 
342 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  72.12 
 
 
348 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  71.82 
 
 
356 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  71.82 
 
 
358 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  72.26 
 
 
356 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  72.12 
 
 
357 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  71.52 
 
 
358 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  71.82 
 
 
356 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  71.73 
 
 
359 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  71.82 
 
 
356 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  71.73 
 
 
359 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  71.82 
 
 
356 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  74.22 
 
 
348 aa  498  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  71.47 
 
 
341 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  72.05 
 
 
336 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  74.39 
 
 
353 aa  495  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1050  recombinase A  70.86 
 
 
355 aa  493  9.999999999999999e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3340  recombinase A  72.59 
 
 
353 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  72.59 
 
 
348 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  72.59 
 
 
348 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  73.48 
 
 
353 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  72.36 
 
 
343 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  72.48 
 
 
358 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  72.5 
 
 
348 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  72.36 
 
 
343 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  69.76 
 
 
377 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1208  recombinase A  69.59 
 
 
353 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  71.47 
 
 
345 aa  491  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  68.21 
 
 
352 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  71.47 
 
 
352 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002519  RecA protein  73.29 
 
 
347 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3031  recombinase A  72.67 
 
 
353 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00473022  hitchhiker  0.000967818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2983  recombinase A  72.36 
 
 
353 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0313902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  69.53 
 
 
357 aa  488  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2948  recombinase A  72.67 
 
 
353 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  69.44 
 
 
346 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  72.36 
 
 
353 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  72.67 
 
 
353 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1300  recombinase A  72.27 
 
 
353 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  69.53 
 
 
357 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  72.67 
 
 
353 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>