More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1765 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1765  recombinase A  100 
 
 
348 aa  701    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  99.71 
 
 
348 aa  700    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  76.44 
 
 
347 aa  549  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  79.76 
 
 
348 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  79.33 
 
 
343 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  81.87 
 
 
343 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  79.33 
 
 
343 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  76.95 
 
 
342 aa  543  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  79.01 
 
 
345 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  75.57 
 
 
348 aa  534  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  76.92 
 
 
345 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0570  recombinase A  82.41 
 
 
344 aa  536  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.244041 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  76.92 
 
 
345 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  76.47 
 
 
346 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  76.47 
 
 
346 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1483  recombinase A  79.18 
 
 
347 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  77.74 
 
 
355 aa  524  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  79.55 
 
 
347 aa  527  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  77.74 
 
 
355 aa  524  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  77.74 
 
 
355 aa  524  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  78.05 
 
 
347 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  77.51 
 
 
355 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  73.78 
 
 
349 aa  521  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  77.68 
 
 
349 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  73.9 
 
 
354 aa  517  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  73.85 
 
 
352 aa  517  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0019  recombinase A  80 
 
 
339 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1476  recombinase A  75.99 
 
 
345 aa  514  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158308  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  76.22 
 
 
354 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  75 
 
 
348 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00149  recombinase A  75.68 
 
 
344 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781257  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  74.93 
 
 
347 aa  512  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  73.49 
 
 
347 aa  511  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  72.12 
 
 
345 aa  507  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  72.48 
 
 
363 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  74.01 
 
 
384 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2197  recombinase A  80.56 
 
 
364 aa  508  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000188561  hitchhiker  0.00000561972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  75.84 
 
 
357 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0981  recA protein  74.85 
 
 
358 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0086  recombinase A  74.63 
 
 
347 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000139683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  74.24 
 
 
363 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3259  recombinase A  77.34 
 
 
343 aa  508  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  75.84 
 
 
359 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  73.46 
 
 
390 aa  510  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  73.39 
 
 
362 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  75.84 
 
 
359 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  70.23 
 
 
352 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  77.09 
 
 
353 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1655  recombinase A  73.87 
 
 
354 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.384834  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  75.84 
 
 
348 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  73.29 
 
 
366 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3213  recombinase A  74.55 
 
 
357 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.996939  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  75.84 
 
 
356 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  74.77 
 
 
343 aa  505  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  75.84 
 
 
356 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  75.84 
 
 
356 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  71.89 
 
 
357 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02549  recombinase A  70.94 
 
 
353 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  75.85 
 
 
356 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  75.85 
 
 
356 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1114  recombinase A  71.55 
 
 
357 aa  502  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  75.85 
 
 
356 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2983  recombinase A  70.94 
 
 
353 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0313902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3138  recombinase A  70.09 
 
 
353 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000383703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  71.55 
 
 
357 aa  501  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3375  recombinase A  73.78 
 
 
356 aa  501  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376283  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  75.85 
 
 
356 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  75.85 
 
 
356 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3240  recombinase A  73.78 
 
 
356 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.245303  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  75.85 
 
 
356 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  70.09 
 
 
353 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  75.54 
 
 
356 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2835  recombinase A  70.94 
 
 
353 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246819  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  70.09 
 
 
353 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02514  hypothetical protein  70.94 
 
 
353 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302057  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  70.94 
 
 
353 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  76.47 
 
 
358 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  71.9 
 
 
352 aa  501  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  73.67 
 
 
353 aa  501  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  76.47 
 
 
358 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  75.77 
 
 
355 aa  503  1e-141  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0901  recombinase A  73.78 
 
 
356 aa  501  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.741416  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  70.94 
 
 
353 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3031  recombinase A  70.09 
 
 
353 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00473022  hitchhiker  0.000967818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2948  recombinase A  70.09 
 
 
353 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  75.85 
 
 
356 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  72.26 
 
 
354 aa  501  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3178  recombinase A  70.94 
 
 
353 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0943419  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  70.94 
 
 
353 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0990  recA protein  71.55 
 
 
353 aa  500  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000616835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  70.43 
 
 
362 aa  501  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3174  recombinase A  72.37 
 
 
352 aa  498  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0591186  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  71.87 
 
 
352 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  73.52 
 
 
362 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  75.85 
 
 
358 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  71.26 
 
 
355 aa  498  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  71.05 
 
 
357 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  71.26 
 
 
357 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1125  recombinase A  70.38 
 
 
357 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1196  recombinase A  70.38 
 
 
357 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>