More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1287 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  100 
 
 		 343 aa  692    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  84.84 
 
 		 348 aa  595  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  81.87 
 
 		 348 aa  572  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  81.87 
 
 		 348 aa  571  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  82.58 
 
 		 342 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1483  recombinase A  84.88 
 
 		 347 aa  569  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  78.82 
 
 		 347 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  80.77 
 
 		 348 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  81.58 
 
 		 347 aa  555  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  80.86 
 
 		 345 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  80.86 
 
 		 345 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  78.78 
 
 		 346 aa  547  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  78.78 
 
 		 346 aa  547  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1655  recombinase A  81.58 
 
 		 354 aa  544  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.384834  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0570  recombinase A  83.69 
 
 		 344 aa  545  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.244041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  80.86 
 
 		 345 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  76.32 
 
 		 343 aa  543  1e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  76.32 
 
 		 343 aa  543  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  79.88 
 
 		 355 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  79.88 
 
 		 355 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  80.37 
 
 		 349 aa  538  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  79.88 
 
 		 355 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  79.88 
 
 		 355 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  76.09 
 
 		 347 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  80.18 
 
 		 347 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  74.93 
 
 		 349 aa  535  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  76.02 
 
 		 352 aa  535  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1476  recombinase A  78.57 
 
 		 345 aa  532  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158308  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  73.68 
 
 		 345 aa  533  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  78.96 
 
 		 354 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3259  recombinase A  79.24 
 
 		 343 aa  531  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  78.96 
 
 		 354 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  78.96 
 
 		 352 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  78.25 
 
 		 347 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0086  recombinase A  77.95 
 
 		 347 aa  527  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  76.83 
 
 		 348 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00149  recombinase A  76.79 
 
 		 344 aa  525  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  74.12 
 
 		 358 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2948  recombinase A  73.67 
 
 		 353 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2197  recombinase A  83.02 
 
 		 364 aa  523  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000188561  hitchhiker  0.00000561972 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3174  recombinase A  74.11 
 
 		 352 aa  521  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0591186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  80.39 
 
 		 356 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  73.67 
 
 		 353 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  73.67 
 
 		 353 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  78.05 
 
 		 358 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  81.03 
 
 		 358 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3138  recombinase A  73.67 
 
 		 353 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  79.38 
 
 		 357 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3031  recombinase A  73.67 
 
 		 353 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00473022  hitchhiker  0.000967818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  81.03 
 
 		 358 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  72.51 
 
 		 354 aa  519  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  70.62 
 
 		 384 aa  518  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  80.39 
 
 		 356 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  80.39 
 
 		 356 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  80.39 
 
 		 356 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  80.39 
 
 		 356 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  78.77 
 
 		 348 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  80.39 
 
 		 356 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  80.39 
 
 		 356 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0019  recombinase A  79.94 
 
 		 339 aa  517  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  78.77 
 
 		 356 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  74.24 
 
 		 363 aa  518  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  80.39 
 
 		 356 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0981  recA protein  70.74 
 
 		 358 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  78.77 
 
 		 356 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  74.78 
 
 		 355 aa  518  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3213  recombinase A  74.24 
 
 		 357 aa  518  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.996939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  78.77 
 
 		 356 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  74.09 
 
 		 347 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02549  recombinase A  72.62 
 
 		 353 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02514  hypothetical protein  72.62 
 
 		 353 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302057  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2983  recombinase A  72.62 
 
 		 353 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0313902  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3178  recombinase A  72.62 
 
 		 353 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0943419  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  72.62 
 
 		 353 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1114  recombinase A  73.94 
 
 		 357 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2835  recombinase A  72.62 
 
 		 353 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246819  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  78.15 
 
 		 359 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  72.62 
 
 		 353 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002519  RecA protein  73.85 
 
 		 347 aa  514  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  78.15 
 
 		 359 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  72.62 
 
 		 353 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0990  recA protein  72.32 
 
 		 353 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000616835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3375  recombinase A  70.2 
 
 		 356 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376283  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  75.08 
 
 		 366 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  75.16 
 
 		 355 aa  512  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0901  recombinase A  70.2 
 
 		 356 aa  511  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.741416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03513  recombinase A  71.89 
 
 		 354 aa  512  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  73.93 
 
 		 363 aa  510  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  73.91 
 
 		 362 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  71.6 
 
 		 357 aa  509  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  75 
 
 		 352 aa  511  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  73.91 
 
 		 362 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  73.6 
 
 		 362 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3240  recombinase A  73.17 
 
 		 356 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.245303  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3117  recombinase A  71.26 
 
 		 355 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1248  recombinase A  71.26 
 
 		 355 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  78.06 
 
 		 377 aa  508  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  74.07 
 
 		 356 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  74.22 
 
 		 363 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3381  recombination protein RecA  75.07 
 
 		 358 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.000000385109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>