More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0387 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0387  recA protein  100 
 
 		 347 aa  700    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  77.33 
 
 		 342 aa  548  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  75.43 
 
 		 347 aa  549  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  83.54 
 
 		 343 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  77.03 
 
 		 348 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  77.74 
 
 		 348 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  77.74 
 
 		 348 aa  538  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1483  recombinase A  80.23 
 
 		 347 aa  540  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0570  recombinase A  79.18 
 
 		 344 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.244041 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  78.66 
 
 		 348 aa  532  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  78.29 
 
 		 345 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  78.29 
 
 		 345 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  79.63 
 
 		 345 aa  529  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00149  recombinase A  74.57 
 
 		 344 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  75.3 
 
 		 343 aa  520  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  75.3 
 
 		 343 aa  520  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03513  recombinase A  72.25 
 
 		 354 aa  519  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1655  recombinase A  79.64 
 
 		 354 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.384834  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  74.7 
 
 		 354 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002519  RecA protein  74.77 
 
 		 347 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  76.22 
 
 		 347 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  72.64 
 
 		 345 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  71.34 
 
 		 347 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1476  recombinase A  74.63 
 
 		 345 aa  513  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158308  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0086  recombinase A  75.91 
 
 		 347 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  72.89 
 
 		 355 aa  511  1e-144  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  74.47 
 
 		 346 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  74.85 
 
 		 363 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1215  recombinase A  72.29 
 
 		 353 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  71.51 
 
 		 357 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3213  recombinase A  69.54 
 
 		 357 aa  504  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.996939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  75.46 
 
 		 349 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0019  recombinase A  77.78 
 
 		 339 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  71.81 
 
 		 357 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  75 
 
 		 355 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  74.39 
 
 		 355 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1125  recombinase A  72.34 
 
 		 357 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1196  recombinase A  72.34 
 
 		 357 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  74.47 
 
 		 346 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  72.95 
 
 		 349 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  74.39 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  74.23 
 
 		 362 aa  503  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  74.4 
 
 		 352 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3126  recombinase A  70.14 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3269  recombinase A  69.28 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0901  recombinase A  71.82 
 
 		 356 aa  501  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.741416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  74.39 
 
 		 355 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3375  recombinase A  71.82 
 
 		 356 aa  501  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  75 
 
 		 358 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1208  recombinase A  70.06 
 
 		 353 aa  502  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1248  recombinase A  70.14 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1114  recombinase A  69.25 
 
 		 357 aa  501  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  74.39 
 
 		 347 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1126  recombinase A  72.56 
 
 		 357 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  74.39 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1046  recombinase A  72.87 
 
 		 355 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.558521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3117  recombinase A  70.14 
 
 		 355 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3240  recombinase A  71.82 
 
 		 356 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.245303  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02549  recombinase A  70.75 
 
 		 353 aa  497  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  76.95 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  76.95 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2983  recombinase A  70.75 
 
 		 353 aa  497  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0313902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  70.75 
 
 		 353 aa  497  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  74.39 
 
 		 354 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  76.95 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  76.95 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  74.39 
 
 		 354 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  77.88 
 
 		 358 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3178  recombinase A  70.75 
 
 		 353 aa  497  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0943419  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2197  recombinase A  79.94 
 
 		 364 aa  498  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000188561  hitchhiker  0.00000561972 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  76.95 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  76.95 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2835  recombinase A  70.75 
 
 		 353 aa  497  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3138  recombinase A  71.34 
 
 		 353 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  78.19 
 
 		 358 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  70.67 
 
 		 352 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  70.75 
 
 		 353 aa  497  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  76.92 
 
 		 357 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  76.31 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3031  recombinase A  71.34 
 
 		 353 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00473022  hitchhiker  0.000967818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3259  recombinase A  77.13 
 
 		 343 aa  498  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1300  recombinase A  70.43 
 
 		 353 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0841  recombinase A  73.82 
 
 		 353 aa  498  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0280148  unclonable  0.0000000182986 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  76.95 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  71.95 
 
 		 363 aa  498  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  76.31 
 
 		 356 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02514  hypothetical protein  70.75 
 
 		 353 aa  497  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302057  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  71.34 
 
 		 353 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  71.34 
 
 		 353 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  70.75 
 
 		 353 aa  497  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2948  recombinase A  71.34 
 
 		 353 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  70.67 
 
 		 347 aa  498  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0990  recA protein  70.45 
 
 		 353 aa  494  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000616835  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  73.48 
 
 		 352 aa  494  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  72.53 
 
 		 343 aa  494  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3174  recombinase A  71.34 
 
 		 352 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0591186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  73.15 
 
 		 366 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  76.64 
 
 		 356 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3340  recombinase A  69.53 
 
 		 353 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  76.31 
 
 		 356 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>