More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2405 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  100 
 
 		 341 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  81.99 
 
 		 336 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  79.38 
 
 		 338 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  79.38 
 
 		 338 aa  548  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  78.31 
 
 		 358 aa  534  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  81.02 
 
 		 333 aa  535  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  81.1 
 
 		 338 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  78.31 
 
 		 358 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  78.05 
 
 		 358 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  81.1 
 
 		 339 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  77.41 
 
 		 358 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  75.38 
 
 		 379 aa  523  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  80 
 
 		 340 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  69.39 
 
 		 355 aa  501  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  72.39 
 
 		 352 aa  501  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  72.39 
 
 		 352 aa  501  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  72.26 
 
 		 366 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  71.78 
 
 		 361 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  71.47 
 
 		 361 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  71.47 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  70.18 
 
 		 343 aa  494  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  71.12 
 
 		 358 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  70.95 
 
 		 356 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  70.95 
 
 		 356 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  70.95 
 
 		 356 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  70.95 
 
 		 356 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  70.95 
 
 		 356 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  70.28 
 
 		 347 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  70.95 
 
 		 356 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  70.95 
 
 		 356 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  70.15 
 
 		 364 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  70.81 
 
 		 358 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  70.95 
 
 		 356 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  70.81 
 
 		 357 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  70.09 
 
 		 343 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  69.05 
 
 		 343 aa  488  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  70.5 
 
 		 359 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  71.34 
 
 		 358 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  70.09 
 
 		 343 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  70.03 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  70.03 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  70.5 
 
 		 359 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  70.03 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  69.94 
 
 		 347 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  68.15 
 
 		 348 aa  485  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  71.17 
 
 		 362 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  70.25 
 
 		 361 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  70.55 
 
 		 362 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  70.19 
 
 		 348 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  71.73 
 
 		 346 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  72.87 
 
 		 356 aa  485  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  70.25 
 
 		 343 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  70.55 
 
 		 363 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  69.91 
 
 		 362 aa  484  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  70.52 
 
 		 363 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  66.97 
 
 		 347 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  71.17 
 
 		 347 aa  485  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  70.86 
 
 		 364 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  68.48 
 
 		 358 aa  481  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  72.99 
 
 		 365 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  64.5 
 
 		 348 aa  481  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  68.58 
 
 		 342 aa  481  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  65.09 
 
 		 347 aa  481  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  69.33 
 
 		 363 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  69.21 
 
 		 362 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  71.17 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  69.88 
 
 		 348 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  67.66 
 
 		 362 aa  481  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  69.54 
 
 		 341 aa  484  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  68.71 
 
 		 350 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  68.4 
 
 		 390 aa  481  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  69.88 
 
 		 348 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  70.25 
 
 		 350 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  67.77 
 
 		 364 aa  478  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  64.5 
 
 		 348 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  68.18 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  67.66 
 
 		 348 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  65.59 
 
 		 378 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  69.02 
 
 		 364 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  66.87 
 
 		 357 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  68.62 
 
 		 377 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  71.92 
 
 		 360 aa  480  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  69.02 
 
 		 345 aa  480  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  69.33 
 
 		 360 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  70.55 
 
 		 359 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  66.37 
 
 		 384 aa  474  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  67.79 
 
 		 361 aa  474  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  69.69 
 
 		 343 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  67.28 
 
 		 345 aa  474  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  67.48 
 
 		 350 aa  477  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  67.58 
 
 		 345 aa  474  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  68.52 
 
 		 355 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  65.77 
 
 		 357 aa  474  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  71.21 
 
 		 349 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  66.97 
 
 		 363 aa  476  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  69.02 
 
 		 368 aa  477  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  67.48 
 
 		 356 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  66.67 
 
 		 350 aa  477  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  67.79 
 
 		 350 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  71.17 
 
 		 366 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>