More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3735 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  99.7 
 
 		 338 aa  678    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  100 
 
 		 338 aa  682    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  90.6 
 
 		 333 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  84.66 
 
 		 336 aa  569  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  88.05 
 
 		 338 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  86.48 
 
 		 340 aa  557  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  86.48 
 
 		 339 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  79.38 
 
 		 341 aa  548  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  79 
 
 		 358 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  77.74 
 
 		 358 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  78.06 
 
 		 358 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  77.43 
 
 		 358 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  71.65 
 
 		 379 aa  500  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  73.99 
 
 		 366 aa  494  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  71.6 
 
 		 352 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  71.6 
 
 		 352 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  70.06 
 
 		 343 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  70.75 
 
 		 347 aa  488  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  74.76 
 
 		 355 aa  490  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  72.93 
 
 		 364 aa  488  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  74.29 
 
 		 365 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  71.52 
 
 		 343 aa  484  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  73.19 
 
 		 361 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  69.44 
 
 		 348 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  69.44 
 
 		 348 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  73.19 
 
 		 361 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  72.04 
 
 		 342 aa  484  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  73.19 
 
 		 424 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  71.7 
 
 		 341 aa  484  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  74.76 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  73.89 
 
 		 360 aa  485  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  72.24 
 
 		 350 aa  484  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  71.52 
 
 		 343 aa  484  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  72.61 
 
 		 347 aa  481  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  68.66 
 
 		 347 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  71.79 
 
 		 355 aa  481  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  71.61 
 
 		 358 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  69.05 
 
 		 348 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  72.5 
 
 		 344 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  72.84 
 
 		 362 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  71.61 
 
 		 361 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  70.98 
 
 		 362 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  72.87 
 
 		 362 aa  477  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  73.04 
 
 		 356 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  68.81 
 
 		 357 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  69.35 
 
 		 343 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  71.83 
 
 		 358 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  65.77 
 
 		 347 aa  478  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  72.84 
 
 		 362 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  71.97 
 
 		 357 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  73.48 
 
 		 343 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  72.64 
 
 		 359 aa  478  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  73.27 
 
 		 347 aa  481  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  73.14 
 
 		 358 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  72.84 
 
 		 363 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  72.56 
 
 		 364 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  71.87 
 
 		 346 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  69.78 
 
 		 345 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  71.61 
 
 		 343 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  71.57 
 
 		 362 aa  477  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  72.52 
 
 		 364 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  69.7 
 
 		 358 aa  477  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  72.2 
 
 		 363 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  69.33 
 
 		 347 aa  477  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  71.88 
 
 		 360 aa  474  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  72.82 
 
 		 358 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  72.84 
 
 		 361 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  69.78 
 
 		 345 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  70.06 
 
 		 345 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  70.53 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  70.53 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  70.53 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  74.06 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  69.88 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  70.53 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  71.75 
 
 		 365 aa  474  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  72.2 
 
 		 363 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  70.85 
 
 		 357 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  70.44 
 
 		 357 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  70.53 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  67.26 
 
 		 390 aa  471  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  68.81 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  70.53 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  70.28 
 
 		 368 aa  474  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  70.53 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  69.64 
 
 		 384 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  69.88 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  72.96 
 
 		 349 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  68.03 
 
 		 348 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  71.2 
 
 		 356 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  68.87 
 
 		 350 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  68.03 
 
 		 348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  68.14 
 
 		 345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  68.52 
 
 		 348 aa  468  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  71.52 
 
 		 356 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  69.5 
 
 		 347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  69.47 
 
 		 364 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  71.2 
 
 		 356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  71.03 
 
 		 348 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  69.5 
 
 		 347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>