More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2528 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  100 
 
 		 343 aa  692    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  70.18 
 
 		 341 aa  494  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  72.67 
 
 		 358 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  70.18 
 
 		 338 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  70.06 
 
 		 338 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  71 
 
 		 358 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  71 
 
 		 358 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  70.69 
 
 		 358 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  70.99 
 
 		 336 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  69.28 
 
 		 379 aa  484  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  68.45 
 
 		 350 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  69.94 
 
 		 343 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  69.57 
 
 		 355 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  68.4 
 
 		 343 aa  476  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  69.35 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  68.18 
 
 		 362 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  69.97 
 
 		 342 aa  475  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  71.34 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  68.18 
 
 		 362 aa  474  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  69.47 
 
 		 360 aa  477  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  69.78 
 
 		 390 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  72.36 
 
 		 338 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  69.33 
 
 		 361 aa  472  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  69.33 
 
 		 424 aa  472  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  68.48 
 
 		 363 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  72.36 
 
 		 339 aa  472  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  70.09 
 
 		 366 aa  471  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  72.44 
 
 		 365 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  68.18 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  68.31 
 
 		 365 aa  471  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  68.79 
 
 		 361 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  69.02 
 
 		 362 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  69.7 
 
 		 341 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  66.96 
 
 		 364 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  66.97 
 
 		 362 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  67.07 
 
 		 362 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  68.71 
 
 		 361 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  68.86 
 
 		 348 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  70.77 
 
 		 333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  67.58 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  68.4 
 
 		 358 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  68.94 
 
 		 361 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  68.85 
 
 		 357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  69.33 
 
 		 360 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  71.74 
 
 		 340 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  67.68 
 
 		 356 aa  470  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  69.02 
 
 		 361 aa  468  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  65.87 
 
 		 363 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  68.71 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  67.28 
 
 		 343 aa  464  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  67.28 
 
 		 343 aa  464  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  66.97 
 
 		 363 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  66.46 
 
 		 348 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  66.46 
 
 		 348 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  66.97 
 
 		 345 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  65.96 
 
 		 357 aa  463  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  66.87 
 
 		 364 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  69.25 
 
 		 347 aa  462  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  66.97 
 
 		 345 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  67.28 
 
 		 345 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  67.18 
 
 		 362 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  65.87 
 
 		 358 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  65.75 
 
 		 359 aa  458  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  66.97 
 
 		 358 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  68.12 
 
 		 344 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  66.08 
 
 		 358 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  66.36 
 
 		 345 aa  458  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  68.1 
 
 		 359 aa  458  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  68 
 
 		 343 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  67.28 
 
 		 343 aa  454  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  63.94 
 
 		 367 aa  456  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  66.77 
 
 		 345 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  64.94 
 
 		 357 aa  457  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  65.85 
 
 		 366 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  66.15 
 
 		 352 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  64.83 
 
 		 348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  65.57 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  66.56 
 
 		 357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  66.56 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  64.53 
 
 		 348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  63.22 
 
 		 347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  65.57 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  65.28 
 
 		 354 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  65.57 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  65.57 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  61.86 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  65.87 
 
 		 356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  65.57 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  66.56 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  65.15 
 
 		 347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  65.57 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  64.31 
 
 		 346 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  64.31 
 
 		 346 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  65.57 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  63.74 
 
 		 356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  65.57 
 
 		 347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  65.53 
 
 		 347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  67.08 
 
 		 346 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  64.22 
 
 		 345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  66.56 
 
 		 355 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>