More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1473 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  100 
 
 
364 aa  736    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  73.33 
 
 
341 aa  528  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  74.31 
 
 
347 aa  524  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  74.23 
 
 
348 aa  524  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  76.69 
 
 
349 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  73.01 
 
 
355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  71.17 
 
 
347 aa  504  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  73.31 
 
 
352 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  73.31 
 
 
352 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  77.29 
 
 
346 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  72.09 
 
 
357 aa  504  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  72.78 
 
 
343 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  71.56 
 
 
365 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  71.47 
 
 
345 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  71.47 
 
 
343 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  70.27 
 
 
347 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  71.85 
 
 
343 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  70.15 
 
 
341 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  71.25 
 
 
359 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  71.83 
 
 
348 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  71.21 
 
 
348 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  72.35 
 
 
343 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  70.94 
 
 
346 aa  492  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  69.07 
 
 
350 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  72.93 
 
 
338 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  68.2 
 
 
383 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  72.06 
 
 
343 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  72.06 
 
 
343 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  70.39 
 
 
338 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  72.06 
 
 
343 aa  489  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  71.65 
 
 
345 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  69.07 
 
 
350 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  69.3 
 
 
350 aa  485  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  71.25 
 
 
378 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  69.72 
 
 
366 aa  484  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  69.42 
 
 
343 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  68.09 
 
 
367 aa  484  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  71.34 
 
 
364 aa  487  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  69.72 
 
 
376 aa  485  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  69.72 
 
 
368 aa  487  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  67.96 
 
 
352 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  69.28 
 
 
348 aa  481  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  69.11 
 
 
362 aa  482  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  67.98 
 
 
351 aa  484  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  71.03 
 
 
345 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  70.81 
 
 
336 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  67.47 
 
 
418 aa  482  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  69.37 
 
 
347 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  69.11 
 
 
346 aa  481  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  69.42 
 
 
347 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  68.77 
 
 
345 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  69.02 
 
 
352 aa  482  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  67.87 
 
 
350 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  69.28 
 
 
348 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  69.42 
 
 
362 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  67.27 
 
 
349 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  70.4 
 
 
356 aa  478  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  68.71 
 
 
361 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  69.38 
 
 
358 aa  480  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  65.98 
 
 
343 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  68.2 
 
 
366 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  67.87 
 
 
350 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  66.47 
 
 
379 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  67.28 
 
 
358 aa  474  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  68.2 
 
 
362 aa  474  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  68.2 
 
 
347 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  68.2 
 
 
347 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  67.6 
 
 
344 aa  474  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  67.17 
 
 
351 aa  477  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  67.68 
 
 
345 aa  477  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  68.2 
 
 
347 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  67.28 
 
 
363 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  65.4 
 
 
355 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  64.81 
 
 
361 aa  471  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  73.1 
 
 
333 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  66.97 
 
 
358 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  63.87 
 
 
352 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  67.71 
 
 
347 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  68.2 
 
 
364 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  70.62 
 
 
347 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  67.89 
 
 
363 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  68.2 
 
 
363 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  69.06 
 
 
360 aa  472  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  66.97 
 
 
358 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  69.02 
 
 
357 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  66.16 
 
 
352 aa  474  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  70.62 
 
 
347 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  72.2 
 
 
348 aa  472  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1920  recA protein  72.39 
 
 
347 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000130185  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  69.87 
 
 
365 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  70.62 
 
 
349 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  66.67 
 
 
361 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  64.29 
 
 
353 aa  468  1.0000000000000001e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  66.06 
 
 
358 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  67.48 
 
 
357 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  64.97 
 
 
344 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  67.98 
 
 
361 aa  470  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  67.28 
 
 
361 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  61.28 
 
 
379 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  67.89 
 
 
364 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>