More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0988 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  100 
 
 		 335 aa  677    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  84.23 
 
 		 337 aa  555  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3557  recA protein  78.72 
 
 		 337 aa  525  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  76.07 
 
 		 355 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  76.85 
 
 		 355 aa  522  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  74.03 
 
 		 364 aa  521  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  72.92 
 
 		 340 aa  509  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  74.53 
 
 		 354 aa  510  1e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0854  recA protein  71.6 
 
 		 336 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61242 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0804  recA protein  69.85 
 
 		 389 aa  475  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  68.01 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  65.64 
 
 		 356 aa  465  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  66.77 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  65.55 
 
 		 361 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  66.46 
 
 		 361 aa  461  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  66.77 
 
 		 361 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  64.72 
 
 		 366 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  65.34 
 
 		 360 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  66.16 
 
 		 364 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  66.46 
 
 		 362 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  63.41 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  64.94 
 
 		 355 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  63.61 
 
 		 343 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  63.22 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  65.14 
 
 		 357 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  66.05 
 
 		 336 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  66.15 
 
 		 360 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  64.76 
 
 		 357 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  66.56 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  65.33 
 
 		 338 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  63.86 
 
 		 338 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  63.75 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  65.63 
 
 		 345 aa  454  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  64.91 
 
 		 343 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  66.56 
 
 		 345 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  64.11 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  64.11 
 
 		 352 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1951  recombinase A  67.8 
 
 		 349 aa  457  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.971416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  64.35 
 
 		 359 aa  455  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  66.14 
 
 		 358 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  65.22 
 
 		 347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  64.67 
 
 		 379 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  63.33 
 
 		 361 aa  451  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  64.24 
 
 		 357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  63.53 
 
 		 347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  64.63 
 
 		 343 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  63.53 
 
 		 347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  63.61 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  64.55 
 
 		 363 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  65.33 
 
 		 364 aa  449  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  66.35 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  64.29 
 
 		 341 aa  450  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  66.56 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  64.53 
 
 		 347 aa  450  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  64.69 
 
 		 358 aa  447  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  66.04 
 
 		 363 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  63.38 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  63.3 
 
 		 365 aa  448  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  64.38 
 
 		 358 aa  447  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  65.73 
 
 		 363 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  65.31 
 
 		 358 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  64.69 
 
 		 358 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  66.88 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  65.31 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  67.9 
 
 		 349 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  62.5 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  62.5 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  61.24 
 
 		 341 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  64.24 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  65.42 
 
 		 364 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  65.63 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  64.6 
 
 		 349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2185  recombinase A  66.67 
 
 		 350 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019841  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  62.8 
 
 		 383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  65.53 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  63.11 
 
 		 352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  65.84 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  67.79 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  62.11 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  62.97 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  62.66 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  64.71 
 
 		 362 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  64.53 
 
 		 346 aa  441  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  62.69 
 
 		 359 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  63.16 
 
 		 348 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  63.3 
 
 		 358 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  66.03 
 
 		 377 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  63.21 
 
 		 344 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  62.42 
 
 		 367 aa  443  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2561  recombinase A  67.89 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  64.11 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  63.92 
 
 		 350 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  63.44 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  64.91 
 
 		 349 aa  438  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  64.86 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  65.73 
 
 		 357 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  64.86 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  64.86 
 
 		 358 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  63.41 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  64.86 
 
 		 358 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>