More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2002 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  100 
 
 		 345 aa  696    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  81.79 
 
 		 347 aa  564  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  76.35 
 
 		 364 aa  539  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0201  recombinase A  80.18 
 
 		 345 aa  535  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.911025  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  75.37 
 
 		 365 aa  533  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  77.2 
 
 		 343 aa  519  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  77.2 
 
 		 343 aa  519  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  77.51 
 
 		 343 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  75.68 
 
 		 344 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1787  recombinase A  77.13 
 
 		 348 aa  509  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.744188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  67.08 
 
 		 336 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  66.15 
 
 		 338 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  63.45 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  65.55 
 
 		 357 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  66.15 
 
 		 338 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  65.63 
 
 		 335 aa  454  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  66.67 
 
 		 357 aa  457  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  64.83 
 
 		 361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  65.44 
 
 		 362 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  65.75 
 
 		 364 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  64.83 
 
 		 424 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  65.44 
 
 		 362 aa  451  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  65.44 
 
 		 361 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  65.24 
 
 		 356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  64.22 
 
 		 361 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  64.02 
 
 		 348 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  64.02 
 
 		 348 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  66.06 
 
 		 355 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  65.44 
 
 		 366 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  66.67 
 
 		 345 aa  447  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  66.67 
 
 		 345 aa  447  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  65.34 
 
 		 359 aa  448  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  66.97 
 
 		 363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  63.03 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  65.02 
 
 		 356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  62.76 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  68.27 
 
 		 365 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  63.61 
 
 		 383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  64.53 
 
 		 360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  63.74 
 
 		 343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  66.97 
 
 		 363 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  64.02 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  63.94 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  62.61 
 
 		 363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  64.11 
 
 		 350 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  64.31 
 
 		 343 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  66.67 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  62.25 
 
 		 362 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  62.95 
 
 		 348 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  64.49 
 
 		 360 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  66.06 
 
 		 363 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  61.11 
 
 		 352 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  61.29 
 
 		 352 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0310  recombinase A  62.69 
 
 		 355 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  63.64 
 
 		 353 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  62.87 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  65.96 
 
 		 366 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  64.85 
 
 		 384 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  63.47 
 
 		 345 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  64.53 
 
 		 363 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  65.96 
 
 		 366 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  63.03 
 
 		 384 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  65.76 
 
 		 338 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  64.99 
 
 		 355 aa  437  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1392  recombinase A  67.8 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  64.51 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  63.53 
 
 		 367 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  65.22 
 
 		 358 aa  435  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  63.91 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  63.38 
 
 		 342 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  60.92 
 
 		 351 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  62.04 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  63.91 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  60.98 
 
 		 358 aa  434  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  61.4 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  65.18 
 
 		 353 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  61.4 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  63 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  63.22 
 
 		 379 aa  435  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  63.33 
 
 		 359 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  63.33 
 
 		 359 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  65.94 
 
 		 333 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  61.96 
 
 		 378 aa  435  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  66.25 
 
 		 340 aa  434  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  62.76 
 
 		 350 aa  434  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  61.4 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  64 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  62.5 
 
 		 350 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  63.3 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  65.35 
 
 		 366 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  62.77 
 
 		 341 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  62.24 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  62.69 
 
 		 362 aa  433  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  63.64 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  63.64 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  63.33 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  61.7 
 
 		 345 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  63.3 
 
 		 364 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  63.61 
 
 		 362 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  63.64 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>