More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03480 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03480  RecA  100 
 
 		 337 aa  682    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  84.15 
 
 		 335 aa  572  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  75.75 
 
 		 355 aa  532  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  77.37 
 
 		 355 aa  528  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3557  recA protein  79.57 
 
 		 337 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  76.62 
 
 		 364 aa  522  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  75.91 
 
 		 354 aa  521  1e-147  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  72.26 
 
 		 340 aa  500  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0804  recA protein  70 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0854  recA protein  73.68 
 
 		 336 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  69.06 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  69.38 
 
 		 360 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  68.85 
 
 		 361 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  67.49 
 
 		 347 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  68.54 
 
 		 361 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  67.29 
 
 		 362 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  67.39 
 
 		 343 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  67.08 
 
 		 366 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  66.87 
 
 		 357 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  68.85 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  66.77 
 
 		 357 aa  461  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  68.62 
 
 		 345 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  68 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  67.91 
 
 		 355 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  66.57 
 
 		 357 aa  457  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  67.91 
 
 		 361 aa  458  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  67.6 
 
 		 359 aa  459  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  68.62 
 
 		 345 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  68.22 
 
 		 362 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  68.54 
 
 		 364 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  66.67 
 
 		 343 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  65.24 
 
 		 350 aa  455  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  66.98 
 
 		 360 aa  454  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  65.36 
 
 		 356 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  65.96 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  65.64 
 
 		 358 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  64.74 
 
 		 347 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  69.09 
 
 		 357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  68.45 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  65.56 
 
 		 358 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  68.45 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  68.45 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  68.45 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  68.67 
 
 		 356 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  68.67 
 
 		 348 aa  447  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  62.54 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  68.67 
 
 		 359 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  67.19 
 
 		 365 aa  450  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  68.45 
 
 		 356 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  65.72 
 
 		 379 aa  450  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  65.72 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  68.67 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  63.75 
 
 		 352 aa  448  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  68.67 
 
 		 359 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  68.45 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  68.67 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  68.45 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  68.45 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  66.26 
 
 		 363 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  65.03 
 
 		 350 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  67.72 
 
 		 358 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  68.27 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  67.19 
 
 		 364 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  65.64 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  66.46 
 
 		 349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  66.46 
 
 		 362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  66.35 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  66.35 
 
 		 346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  67.41 
 
 		 358 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  63.69 
 
 		 367 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  65.41 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  63.75 
 
 		 352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  63.94 
 
 		 358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  66.26 
 
 		 345 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  63.1 
 
 		 336 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  65 
 
 		 390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  65.73 
 
 		 347 aa  443  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  66.04 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  64.53 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  64.53 
 
 		 348 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  64.4 
 
 		 376 aa  444  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  65.95 
 
 		 362 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  63.19 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  64.17 
 
 		 358 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  63.19 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  64.72 
 
 		 359 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  65.84 
 
 		 364 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  65.53 
 
 		 363 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  65.74 
 
 		 348 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  65.84 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  65.84 
 
 		 363 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  64.91 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  64.49 
 
 		 358 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  63.78 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  64.71 
 
 		 352 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  63.78 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  64.72 
 
 		 357 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  65.19 
 
 		 365 aa  442  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  66.25 
 
 		 350 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  63.78 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>