More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0804 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0804  recA protein  100 
 
 		 389 aa  783    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  70.59 
 
 		 337 aa  478  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  69.85 
 
 		 335 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  66.97 
 
 		 355 aa  455  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  66.17 
 
 		 340 aa  451  1e-125  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  63.98 
 
 		 355 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  64.04 
 
 		 364 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  65.26 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3557  recA protein  68.37 
 
 		 337 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  63.8 
 
 		 357 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  61.61 
 
 		 354 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  65.26 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  63.19 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  62.8 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  61.65 
 
 		 358 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  62 
 
 		 358 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  62 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  62.5 
 
 		 361 aa  431  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  62.8 
 
 		 361 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  60.48 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  63.11 
 
 		 362 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  62.8 
 
 		 362 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  63.64 
 
 		 363 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  62.58 
 
 		 360 aa  431  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  59.89 
 
 		 359 aa  430  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  60.83 
 
 		 384 aa  428  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  64.38 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  64.38 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  64.38 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  64.38 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  62.39 
 
 		 343 aa  427  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  64.38 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  64.38 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  60.88 
 
 		 341 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  59.28 
 
 		 349 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  62.91 
 
 		 377 aa  425  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  62.8 
 
 		 364 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  64.38 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  64.38 
 
 		 356 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  63.03 
 
 		 362 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  63.75 
 
 		 359 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  64.06 
 
 		 357 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  63.75 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  63.75 
 
 		 348 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  60.86 
 
 		 366 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  62.39 
 
 		 357 aa  424  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  63.11 
 
 		 355 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  63.75 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  61.59 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  59.25 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  60.36 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  63.75 
 
 		 359 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  63.75 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03513  recombinase A  57.06 
 
 		 354 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  59.71 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  59.71 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  62.5 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  60.67 
 
 		 361 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  61.47 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  60.24 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  59.76 
 
 		 349 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  62.01 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  59.46 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  61.29 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  57.59 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  62.01 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00149  recombinase A  61.36 
 
 		 344 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0854  recA protein  63.39 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61242 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  59.17 
 
 		 365 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1248  recombinase A  59.17 
 
 		 355 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3117  recombinase A  59.17 
 
 		 355 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  59.59 
 
 		 362 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  59.39 
 
 		 343 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3126  recombinase A  59.17 
 
 		 355 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  63.21 
 
 		 365 aa  414  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1208  recombinase A  56.71 
 
 		 353 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  59.88 
 
 		 362 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  60 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3269  recombinase A  59.17 
 
 		 355 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  59.17 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0086  recombinase A  61 
 
 		 347 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  58.13 
 
 		 390 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  61.16 
 
 		 356 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  58.46 
 
 		 354 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  59.16 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  59.7 
 
 		 358 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  58.86 
 
 		 346 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  55.01 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  58.58 
 
 		 357 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  60.78 
 
 		 342 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  59.46 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  61.89 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  60.98 
 
 		 347 aa  411  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3340  recombinase A  59.1 
 
 		 353 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  60.12 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  59.05 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3174  recombinase A  58.41 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0591186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  60.3 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  58.86 
 
 		 346 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1215  recombinase A  59.1 
 
 		 353 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>