More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0881 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0881  recombinase A  100 
 
 		 340 aa  686    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  72.92 
 
 		 335 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  73.65 
 
 		 337 aa  489  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3557  recA protein  73.04 
 
 		 337 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  67.58 
 
 		 354 aa  473  1e-132  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  68.58 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  69.18 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  66.97 
 
 		 364 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  67.91 
 
 		 341 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0854  recA protein  68.5 
 
 		 336 aa  458  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  66.25 
 
 		 357 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  64.09 
 
 		 343 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  65.31 
 
 		 366 aa  447  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  62.42 
 
 		 379 aa  449  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  65.73 
 
 		 343 aa  448  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0804  recA protein  66.17 
 
 		 389 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  64.72 
 
 		 347 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  65 
 
 		 350 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  66.46 
 
 		 348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  63.91 
 
 		 358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  63.69 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  63.69 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  64.06 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  63.66 
 
 		 418 aa  443  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  63.72 
 
 		 383 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  62.5 
 
 		 362 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  63.75 
 
 		 355 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  66.25 
 
 		 345 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  61.24 
 
 		 357 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  62.2 
 
 		 364 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  65.63 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  65.31 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  64.24 
 
 		 346 aa  441  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  63.22 
 
 		 348 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  63.22 
 
 		 348 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  62.16 
 
 		 348 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  64.06 
 
 		 365 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  63.69 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  64.38 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  66.15 
 
 		 346 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  65.03 
 
 		 347 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  63.47 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  63.89 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  61.9 
 
 		 360 aa  438  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  62.23 
 
 		 352 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  62.23 
 
 		 352 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  65.2 
 
 		 361 aa  440  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  63.86 
 
 		 355 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  64.38 
 
 		 367 aa  441  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  63.69 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  63.64 
 
 		 376 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  63.64 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  62.88 
 
 		 350 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  65.22 
 
 		 358 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  64 
 
 		 365 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  62.58 
 
 		 350 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  62.92 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  65.59 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  63.44 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  62.31 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  64 
 
 		 362 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  62.61 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  63.24 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  62.81 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  61.67 
 
 		 365 aa  435  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  64.17 
 
 		 343 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  63.12 
 
 		 348 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  63.24 
 
 		 338 aa  434  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  62.62 
 
 		 361 aa  435  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  61.7 
 
 		 347 aa  434  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  62.92 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  62.27 
 
 		 352 aa  434  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  66.36 
 
 		 349 aa  435  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  62.12 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  64.4 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  64.11 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  61.01 
 
 		 362 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  61.33 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  64.38 
 
 		 345 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  63.75 
 
 		 350 aa  436  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  62.92 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  65.4 
 
 		 368 aa  434  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  63.16 
 
 		 358 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  62.46 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  62.35 
 
 		 384 aa  431  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  60.12 
 
 		 361 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1951  recombinase A  64.31 
 
 		 349 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.971416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  64.56 
 
 		 364 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  61.99 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  60.42 
 
 		 361 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  61.4 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  64.54 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  60.98 
 
 		 364 aa  433  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  62.42 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  64.54 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  61.73 
 
 		 360 aa  433  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  62.58 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  61.85 
 
 		 352 aa  433  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  62.69 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  60.12 
 
 		 424 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>