More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10720 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  100 
 
 		 361 aa  730    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  79.94 
 
 		 352 aa  548  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  77.29 
 
 		 352 aa  540  9.999999999999999e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  68.39 
 
 		 365 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  67.98 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  69.54 
 
 		 348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  69.11 
 
 		 345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  68.52 
 
 		 357 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  65.98 
 
 		 350 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  67.67 
 
 		 345 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  66.47 
 
 		 347 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  67.89 
 
 		 347 aa  464  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  66.17 
 
 		 345 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  66.87 
 
 		 347 aa  463  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  67.58 
 
 		 359 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  64.95 
 
 		 378 aa  461  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  67.18 
 
 		 341 aa  461  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  65.01 
 
 		 350 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  67.28 
 
 		 347 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  66.67 
 
 		 376 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  66.67 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  65.44 
 
 		 355 aa  458  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  67.6 
 
 		 364 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  65.28 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  66.77 
 
 		 368 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  69.33 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  65.28 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  66.67 
 
 		 346 aa  455  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  66.87 
 
 		 367 aa  456  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  65.38 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  65.28 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  64.22 
 
 		 349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  66.46 
 
 		 348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  66.06 
 
 		 345 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  66.46 
 
 		 348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  66.56 
 
 		 341 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  65.24 
 
 		 366 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  66.67 
 
 		 351 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  63.45 
 
 		 350 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  66.36 
 
 		 344 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  65.94 
 
 		 351 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  62.46 
 
 		 418 aa  448  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  64.41 
 
 		 350 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  65.14 
 
 		 343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  64.2 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0779  recA protein  70.8 
 
 		 362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000418573  normal  0.0314858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  65.89 
 
 		 346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  66.15 
 
 		 353 aa  444  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  64.22 
 
 		 383 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  65.33 
 
 		 352 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  61.4 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  61.78 
 
 		 352 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  62.99 
 
 		 352 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  65.2 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  62.76 
 
 		 363 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  63.96 
 
 		 379 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  61.29 
 
 		 342 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  63.55 
 
 		 379 aa  440  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  65.02 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  62.39 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  64.49 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  64.71 
 
 		 364 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  63.61 
 
 		 351 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  66.46 
 
 		 349 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  63.47 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  61.88 
 
 		 362 aa  434  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  63.47 
 
 		 362 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  63.16 
 
 		 346 aa  434  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  63.12 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  63.86 
 
 		 336 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  62.85 
 
 		 362 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  61.71 
 
 		 359 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  63.2 
 
 		 343 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  62.85 
 
 		 343 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  60.06 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  63.16 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  64.17 
 
 		 343 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  66.26 
 
 		 343 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  63.69 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  62.96 
 
 		 358 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  62.01 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  62.54 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  62.54 
 
 		 362 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  63.78 
 
 		 362 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  64.42 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  63.47 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  63.47 
 
 		 350 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  64.15 
 
 		 365 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  63.16 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2960  recombinase A  66.87 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0334216  hitchhiker  0.0000660744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  62.31 
 
 		 361 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  67.28 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  63.44 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  63.44 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  62.23 
 
 		 364 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  63.24 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  62.23 
 
 		 363 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  62.39 
 
 		 338 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  62.24 
 
 		 358 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  63.44 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>