More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3045 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  100 
 
 		 355 aa  719    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  80.53 
 
 		 364 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  81.68 
 
 		 355 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  80.12 
 
 		 354 aa  555  1e-157  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  76.85 
 
 		 335 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  77.12 
 
 		 337 aa  521  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3557  recA protein  80.25 
 
 		 337 aa  519  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0854  recA protein  73.72 
 
 		 336 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61242 
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  69.18 
 
 		 340 aa  473  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  67.76 
 
 		 358 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  66.57 
 
 		 350 aa  472  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  67.89 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  68.11 
 
 		 363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  67.28 
 
 		 361 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  68.42 
 
 		 363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  67.89 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  68.2 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  66.07 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  68.11 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  67.89 
 
 		 364 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  67.8 
 
 		 363 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  66.36 
 
 		 360 aa  464  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  66.07 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  67.28 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  68.2 
 
 		 361 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  66.07 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  66.67 
 
 		 361 aa  461  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  64.06 
 
 		 350 aa  464  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  66.87 
 
 		 350 aa  464  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  67.58 
 
 		 366 aa  463  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  67.18 
 
 		 356 aa  463  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  66.87 
 
 		 376 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  68.21 
 
 		 418 aa  463  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  67.8 
 
 		 362 aa  461  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  66.98 
 
 		 350 aa  461  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  66.57 
 
 		 359 aa  460  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  66.67 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  63.66 
 
 		 343 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  66.67 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  66.67 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  66.67 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  65.1 
 
 		 343 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  68.11 
 
 		 362 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  66.67 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  63.58 
 
 		 343 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  66.38 
 
 		 356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  67.19 
 
 		 379 aa  458  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  67.28 
 
 		 346 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  66.06 
 
 		 360 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  66.67 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  66.77 
 
 		 359 aa  459  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  66.67 
 
 		 350 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  64.69 
 
 		 352 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  66.67 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  64.5 
 
 		 336 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  64.99 
 
 		 352 aa  454  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  67.17 
 
 		 358 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  65.85 
 
 		 366 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  64.14 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  66.38 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  65.74 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  65.44 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  63.16 
 
 		 358 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  63.39 
 
 		 367 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  67.86 
 
 		 358 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0804  recA protein  66.97 
 
 		 389 aa  455  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  66.38 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  63.45 
 
 		 357 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  68.09 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  66.38 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  66.98 
 
 		 345 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  63.56 
 
 		 363 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  66.37 
 
 		 359 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  67.37 
 
 		 357 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  66.15 
 
 		 365 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  63.39 
 
 		 348 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  63.2 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  63.56 
 
 		 384 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  66.67 
 
 		 364 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  63.84 
 
 		 362 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  66.26 
 
 		 365 aa  451  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  63.16 
 
 		 358 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  63.16 
 
 		 358 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1951  recombinase A  68.22 
 
 		 349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.971416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  63.37 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  63.08 
 
 		 352 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  65.33 
 
 		 355 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  66.37 
 
 		 359 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  65.54 
 
 		 358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  67.86 
 
 		 358 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  62.69 
 
 		 390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  66.36 
 
 		 345 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  65.74 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  65.14 
 
 		 345 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  64.83 
 
 		 347 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  65.74 
 
 		 345 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  65.24 
 
 		 357 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  63.42 
 
 		 347 aa  448  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  64.2 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  64.37 
 
 		 351 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>