More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0523 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  100 
 
 
362 aa  734    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  75.23 
 
 
364 aa  519  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  67.05 
 
 
376 aa  501  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  73.25 
 
 
385 aa  503  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  71.47 
 
 
355 aa  496  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  69.35 
 
 
347 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  71.64 
 
 
343 aa  488  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  71.51 
 
 
343 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  71.93 
 
 
343 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  69.35 
 
 
347 aa  489  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  73.17 
 
 
343 aa  488  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  71.05 
 
 
343 aa  486  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  73.17 
 
 
343 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  69.97 
 
 
349 aa  476  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  68.67 
 
 
379 aa  473  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  66.67 
 
 
379 aa  473  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  62.91 
 
 
357 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  67.08 
 
 
344 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  68.09 
 
 
387 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  67.52 
 
 
364 aa  461  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  62.1 
 
 
347 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  64.69 
 
 
341 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  64 
 
 
358 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  61.65 
 
 
348 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  64.4 
 
 
347 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  63.17 
 
 
350 aa  455  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  63.22 
 
 
366 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  65.52 
 
 
346 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  61.99 
 
 
378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  63.64 
 
 
341 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  65.02 
 
 
348 aa  451  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  64.26 
 
 
360 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  64.71 
 
 
390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  63.52 
 
 
348 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  61.99 
 
 
343 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  61.96 
 
 
365 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  60.69 
 
 
347 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  60.7 
 
 
350 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  63.64 
 
 
343 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  65.2 
 
 
356 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  62.39 
 
 
348 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  61.43 
 
 
352 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  62.46 
 
 
352 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  62.89 
 
 
348 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  63.69 
 
 
338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  60.12 
 
 
366 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  62.73 
 
 
346 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  61.23 
 
 
367 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  63.69 
 
 
338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  63.5 
 
 
357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  64.24 
 
 
350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  61.58 
 
 
347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  62.96 
 
 
346 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1920  recA protein  67.8 
 
 
347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000130185  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  61.8 
 
 
350 aa  445  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  64.99 
 
 
346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  63.64 
 
 
347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  62.73 
 
 
345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  61.58 
 
 
347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  61.58 
 
 
347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  62.73 
 
 
350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  63.27 
 
 
358 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  63.32 
 
 
357 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  62.7 
 
 
359 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  63.35 
 
 
352 aa  443  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  65 
 
 
349 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  61.96 
 
 
345 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  64.11 
 
 
379 aa  443  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  61.38 
 
 
357 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  61.66 
 
 
347 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  63.24 
 
 
368 aa  444  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  63.38 
 
 
347 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  59.94 
 
 
345 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  62.39 
 
 
383 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  59.94 
 
 
345 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  61.38 
 
 
356 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  63.26 
 
 
347 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  62.07 
 
 
376 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  63.47 
 
 
347 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  62.46 
 
 
363 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  58.36 
 
 
379 aa  441  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  59.59 
 
 
351 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  62.04 
 
 
364 aa  438  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  60.92 
 
 
418 aa  438  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  61.35 
 
 
345 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  65.43 
 
 
343 aa  437  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  66.46 
 
 
344 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  62.04 
 
 
359 aa  438  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  60.35 
 
 
347 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  61.03 
 
 
351 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  62.7 
 
 
336 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  60.8 
 
 
348 aa  434  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  62.62 
 
 
358 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  61.05 
 
 
362 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  57.97 
 
 
352 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  59.25 
 
 
358 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  62.73 
 
 
363 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  63.04 
 
 
363 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  61.16 
 
 
343 aa  434  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  62.88 
 
 
363 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>