More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3919 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3919  recA protein  100 
 
 		 344 aa  686    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  83.04 
 
 		 347 aa  570  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  81.1 
 
 		 346 aa  568  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  82.74 
 
 		 350 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  82.46 
 
 		 345 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  81.34 
 
 		 345 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  81.52 
 
 		 347 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  82.98 
 
 		 376 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  81.08 
 
 		 359 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  80.54 
 
 		 366 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  83.44 
 
 		 348 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  82.67 
 
 		 350 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  81.23 
 
 		 347 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  80.99 
 
 		 345 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  81.52 
 
 		 350 aa  557  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  82.82 
 
 		 348 aa  558  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  80.12 
 
 		 350 aa  558  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  79.64 
 
 		 365 aa  557  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  81.96 
 
 		 347 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  81.96 
 
 		 347 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  78.32 
 
 		 349 aa  555  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  82.89 
 
 		 348 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  79.46 
 
 		 345 aa  557  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  81.96 
 
 		 347 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  79.58 
 
 		 367 aa  552  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  81.76 
 
 		 350 aa  554  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  77.49 
 
 		 352 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  78.51 
 
 		 378 aa  541  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  77.84 
 
 		 383 aa  538  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  78.12 
 
 		 368 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  78.59 
 
 		 364 aa  536  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  77.61 
 
 		 351 aa  531  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  77.04 
 
 		 352 aa  528  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  77.64 
 
 		 351 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  73.64 
 
 		 418 aa  513  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  71.6 
 
 		 379 aa  496  1e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  67.26 
 
 		 346 aa  491  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  68.6 
 
 		 364 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  65.24 
 
 		 347 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  68.33 
 
 		 346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  67.81 
 
 		 344 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  66.15 
 
 		 347 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  66.15 
 
 		 347 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  65.06 
 
 		 341 aa  461  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  68.4 
 
 		 348 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  64.42 
 
 		 341 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  67.9 
 
 		 346 aa  460  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  65.29 
 
 		 343 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  66.47 
 
 		 379 aa  454  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  63.91 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  67.9 
 
 		 342 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  64.92 
 
 		 355 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  67.18 
 
 		 349 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  68.73 
 
 		 351 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  66.36 
 
 		 362 aa  454  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  63.75 
 
 		 352 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  63.75 
 
 		 352 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  64.83 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  63.83 
 
 		 358 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  66.06 
 
 		 363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  66.97 
 
 		 361 aa  451  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  63.83 
 
 		 350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  63.11 
 
 		 390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1655  recombinase A  68.17 
 
 		 354 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.384834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  66.46 
 
 		 336 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  64.22 
 
 		 343 aa  448  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  64.6 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  65.94 
 
 		 358 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  63.89 
 
 		 347 aa  448  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  64.09 
 
 		 352 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  65.94 
 
 		 360 aa  450  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  61.7 
 
 		 357 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  62.24 
 
 		 361 aa  447  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  65.33 
 
 		 347 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  65.62 
 
 		 345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  66.67 
 
 		 345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  63.78 
 
 		 355 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  64.92 
 
 		 349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  63.41 
 
 		 364 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  64.2 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  64.2 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  64.11 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  64.17 
 
 		 344 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  61.52 
 
 		 362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  63.41 
 
 		 355 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  63.99 
 
 		 352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  64.11 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  64.42 
 
 		 352 aa  444  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  65.62 
 
 		 345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  65.42 
 
 		 356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  64.91 
 
 		 348 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  62.84 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1920  recA protein  64.81 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000130185  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  65.63 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  63.72 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  62.24 
 
 		 361 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  63.78 
 
 		 355 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  61.22 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  66.05 
 
 		 343 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  63.47 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>