More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0972 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4116  recombinase A  90.14 
 
 
356 aa  634    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.979014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  100 
 
 
349 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  100 
 
 
349 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0348  recombinase A  82.93 
 
 
356 aa  550  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4925  recombinase A  81.85 
 
 
358 aa  548  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705325  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  77.68 
 
 
360 aa  548  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1133  recombinase A  79.2 
 
 
377 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  80.73 
 
 
376 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20071  recombinase A  79.2 
 
 
377 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  80.43 
 
 
374 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  78.59 
 
 
367 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0721  recA protein  81.79 
 
 
359 aa  538  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1671  recombinase A  77.1 
 
 
357 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22971  recombinase A  79.51 
 
 
379 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  77.04 
 
 
365 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  78.02 
 
 
365 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  78.02 
 
 
365 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17441  recombinase A  77.4 
 
 
370 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  65.17 
 
 
352 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  65.35 
 
 
345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  64.53 
 
 
365 aa  448  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  64.53 
 
 
345 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  63.83 
 
 
350 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  65.74 
 
 
345 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  62.99 
 
 
369 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  63.33 
 
 
347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  64.44 
 
 
347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  64.13 
 
 
346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  63.91 
 
 
347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  63.33 
 
 
347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  63.33 
 
 
347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  64.02 
 
 
359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  64.72 
 
 
364 aa  443  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  63.53 
 
 
350 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  63.61 
 
 
348 aa  441  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  63.61 
 
 
366 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  64.53 
 
 
376 aa  443  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  65.14 
 
 
350 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  64.22 
 
 
345 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  63.22 
 
 
350 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  64.18 
 
 
361 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  63.13 
 
 
348 aa  438  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  63.11 
 
 
352 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  65.34 
 
 
424 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  63.28 
 
 
383 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  63.34 
 
 
348 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  62.65 
 
 
348 aa  434  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  63.89 
 
 
347 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  65.43 
 
 
347 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  63.8 
 
 
341 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  64.42 
 
 
346 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  63.13 
 
 
348 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  61.09 
 
 
367 aa  437  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  63.89 
 
 
347 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  65.02 
 
 
350 aa  435  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  63.58 
 
 
378 aa  435  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  63.88 
 
 
361 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  66.36 
 
 
359 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  64.42 
 
 
346 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  61.28 
 
 
351 aa  435  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  64.43 
 
 
431 aa  435  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  64.51 
 
 
349 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  62.39 
 
 
363 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  62.96 
 
 
348 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  64.81 
 
 
354 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  63.86 
 
 
345 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  64.51 
 
 
355 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  63.02 
 
 
341 aa  431  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  62.35 
 
 
348 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  63.69 
 
 
347 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  65.94 
 
 
343 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  65.85 
 
 
356 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  62.35 
 
 
349 aa  431  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  62.88 
 
 
355 aa  433  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  61.89 
 
 
418 aa  432  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  65.12 
 
 
360 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  65 
 
 
344 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  65.63 
 
 
336 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  63.86 
 
 
345 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  63.24 
 
 
347 aa  433  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  63.3 
 
 
350 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  63.91 
 
 
368 aa  431  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  62.01 
 
 
347 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  64.51 
 
 
355 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  65.33 
 
 
357 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  64.81 
 
 
354 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  64.51 
 
 
355 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  65.12 
 
 
352 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  64.51 
 
 
355 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  59.94 
 
 
364 aa  428  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  60.54 
 
 
355 aa  431  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  64 
 
 
390 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  61.86 
 
 
414 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  61.4 
 
 
347 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  64.22 
 
 
342 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  61.7 
 
 
362 aa  425  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  58.18 
 
 
354 aa  426  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  63.27 
 
 
346 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  62.27 
 
 
357 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  65.53 
 
 
349 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>