More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0872 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0872  recombinase A  100 
 
 		 414 aa  835    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  68.63 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  67.58 
 
 		 365 aa  461  9.999999999999999e-129  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  66.67 
 
 		 342 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  68.5 
 
 		 336 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  66.26 
 
 		 361 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  65.64 
 
 		 424 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  65.64 
 
 		 361 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  67.38 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  65.88 
 
 		 362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  65.85 
 
 		 347 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  69.54 
 
 		 345 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  68.32 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  65.53 
 
 		 357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  67.58 
 
 		 349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  64.92 
 
 		 347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  66.77 
 
 		 347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  67.18 
 
 		 347 aa  448  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  68.42 
 
 		 362 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  68.62 
 
 		 347 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  67.49 
 
 		 362 aa  448  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  67.7 
 
 		 366 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  69.23 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  67.69 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  65.28 
 
 		 363 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  65.84 
 
 		 357 aa  451  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  66.87 
 
 		 355 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  65.15 
 
 		 348 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  69.88 
 
 		 359 aa  450  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  68.94 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  66.26 
 
 		 383 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  64.69 
 
 		 361 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  68.11 
 
 		 364 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  66.67 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  66.87 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  66.56 
 
 		 362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  66.87 
 
 		 343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  66.46 
 
 		 378 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  68.01 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  67.58 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  65.58 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  63.51 
 
 		 364 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  67.88 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  67.49 
 
 		 362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  66.87 
 
 		 360 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  63.71 
 
 		 352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  64.99 
 
 		 363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  65.12 
 
 		 390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  66.15 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  65.94 
 
 		 361 aa  441  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  67.8 
 
 		 366 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  67.69 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  67.8 
 
 		 366 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  67.8 
 
 		 366 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  65.23 
 
 		 341 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  65.75 
 
 		 354 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  66.67 
 
 		 376 aa  443  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  64.91 
 
 		 343 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  64.69 
 
 		 364 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  63.99 
 
 		 352 aa  442  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  66.26 
 
 		 366 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  67.69 
 
 		 345 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  65.75 
 
 		 359 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  67.69 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  65.85 
 
 		 348 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  63.43 
 
 		 352 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  67.38 
 
 		 350 aa  441  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  67.69 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  65.85 
 
 		 348 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  65.14 
 
 		 348 aa  439  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  64.07 
 
 		 355 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  61.85 
 
 		 345 aa  441  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  65.14 
 
 		 347 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5503  recA protein  65.29 
 
 		 363 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  64.46 
 
 		 352 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  67.38 
 
 		 350 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  62.61 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0291  recA protein  65.29 
 
 		 363 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0355806  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  68.94 
 
 		 357 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  66.46 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  68.94 
 
 		 357 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  65.45 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  65.03 
 
 		 357 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  65.54 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  66.15 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  65.45 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  64.81 
 
 		 350 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0623  recA protein  61.06 
 
 		 352 aa  441  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.306263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  65.66 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  64.05 
 
 		 355 aa  438  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  64.72 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  63.01 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  65.49 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  66.46 
 
 		 350 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  66.77 
 
 		 350 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  62.39 
 
 		 384 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  67.18 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  65.54 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  62.87 
 
 		 345 aa  438  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  64.92 
 
 		 352 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>