More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0131 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  100 
 
 
365 aa  730    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  67.58 
 
 
414 aa  461  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  60.37 
 
 
336 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  60.18 
 
 
355 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  58.63 
 
 
364 aa  411  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  59.51 
 
 
343 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  61.61 
 
 
359 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  59.63 
 
 
338 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  61.9 
 
 
347 aa  408  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  61.71 
 
 
379 aa  408  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  59.88 
 
 
348 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  59.88 
 
 
348 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  59.13 
 
 
345 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  59.38 
 
 
347 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  60.68 
 
 
358 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  58.95 
 
 
348 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  57.72 
 
 
347 aa  408  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  57.31 
 
 
341 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  59.13 
 
 
345 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  57.72 
 
 
347 aa  408  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  59.45 
 
 
346 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  59.38 
 
 
348 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  59.63 
 
 
338 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  60.37 
 
 
347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  58.41 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  58.51 
 
 
341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  60.37 
 
 
358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  57.01 
 
 
357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  60.06 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  58.95 
 
 
352 aa  404  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  58.95 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  59.13 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  59.57 
 
 
347 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  60.37 
 
 
358 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  60.18 
 
 
356 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  58.51 
 
 
362 aa  403  1e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  57.28 
 
 
343 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  57.35 
 
 
349 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  56.19 
 
 
345 aa  401  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  58.02 
 
 
343 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  58.02 
 
 
361 aa  401  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  59.82 
 
 
359 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  57.75 
 
 
354 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  55.69 
 
 
353 aa  403  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  59.13 
 
 
366 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  59.08 
 
 
348 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  57.72 
 
 
350 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  58.81 
 
 
362 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  59.76 
 
 
365 aa  402  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  56.1 
 
 
357 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  59.82 
 
 
356 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  58.51 
 
 
364 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  57.6 
 
 
362 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  59.82 
 
 
356 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  57.31 
 
 
363 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  59.82 
 
 
359 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  59.82 
 
 
356 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  57.72 
 
 
347 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  57.4 
 
 
358 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  58.66 
 
 
359 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  57.91 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  58.02 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  55.49 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  56.62 
 
 
342 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  59.82 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  57.74 
 
 
349 aa  398  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3269  recombinase A  57.88 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  59.51 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  61.11 
 
 
327 aa  401  9.999999999999999e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  57.8 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  59.08 
 
 
348 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1248  recombinase A  57.88 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  57.41 
 
 
361 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0206  recA protein  57.39 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.613588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  57.93 
 
 
361 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  58.66 
 
 
355 aa  401  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  59.02 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3126  recombinase A  57.88 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  58.39 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  58.39 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3117  recombinase A  57.88 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  59.75 
 
 
365 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  57.28 
 
 
390 aa  398  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  58.95 
 
 
350 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  59.2 
 
 
356 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  57.41 
 
 
345 aa  394  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  59.26 
 
 
347 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  59.2 
 
 
356 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  59.2 
 
 
356 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  59.2 
 
 
356 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  58.2 
 
 
356 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  59.2 
 
 
356 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  57.69 
 
 
358 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  57.1 
 
 
363 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0634  recombinase A  57.14 
 
 
347 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  59.2 
 
 
356 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  57.88 
 
 
357 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  58.46 
 
 
343 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  59.01 
 
 
350 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  59.26 
 
 
347 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0979046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>