More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0296 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0296  recA protein  100 
 
 
339 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.197187  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  64.51 
 
 
348 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  62.54 
 
 
345 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  60.96 
 
 
365 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  59.21 
 
 
347 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  60.73 
 
 
366 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  62.12 
 
 
345 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  60.73 
 
 
345 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  61.61 
 
 
355 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  61.54 
 
 
376 aa  411  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  61.44 
 
 
364 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  60.92 
 
 
352 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  61.23 
 
 
347 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  58.51 
 
 
367 aa  411  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  61.23 
 
 
359 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  60.92 
 
 
347 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  58.51 
 
 
343 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  60.62 
 
 
350 aa  408  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  60.74 
 
 
347 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  60.31 
 
 
348 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  59.82 
 
 
341 aa  408  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  59.46 
 
 
383 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  59.09 
 
 
346 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  60.74 
 
 
347 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  61.23 
 
 
345 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  60.62 
 
 
350 aa  408  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  60.31 
 
 
348 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  60.3 
 
 
350 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  60.74 
 
 
347 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  60.62 
 
 
347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  60.31 
 
 
357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  61.35 
 
 
349 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  60.62 
 
 
346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  60 
 
 
378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  58.61 
 
 
352 aa  401  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  59.69 
 
 
350 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  60.62 
 
 
368 aa  403  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  58.66 
 
 
347 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  59.69 
 
 
350 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  58.66 
 
 
347 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  60.06 
 
 
364 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  58.26 
 
 
362 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  57.36 
 
 
346 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  58.01 
 
 
351 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  63.84 
 
 
356 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  57.14 
 
 
347 aa  395  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  58.39 
 
 
356 aa  395  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  59.38 
 
 
351 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  61.85 
 
 
348 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  58.36 
 
 
349 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  55.32 
 
 
348 aa  391  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  56.76 
 
 
349 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  57.67 
 
 
418 aa  394  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  59.08 
 
 
343 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  55.82 
 
 
350 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  57.61 
 
 
358 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  61.04 
 
 
345 aa  388  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  59.63 
 
 
346 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3919  recA protein  60.62 
 
 
344 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  61.73 
 
 
344 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  62.15 
 
 
356 aa  388  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  56.36 
 
 
363 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  56.31 
 
 
361 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1920  recA protein  60.91 
 
 
347 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000130185  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  58.2 
 
 
343 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  57.67 
 
 
361 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  56.36 
 
 
362 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  56.48 
 
 
360 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  56.31 
 
 
424 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  56.71 
 
 
357 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  61.23 
 
 
343 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  55.12 
 
 
363 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  56.63 
 
 
345 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  55.12 
 
 
362 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  56.92 
 
 
344 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  56.62 
 
 
358 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  56.62 
 
 
364 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  56.97 
 
 
366 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  57.32 
 
 
338 aa  381  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  54.71 
 
 
347 aa  384  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  58.77 
 
 
379 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  57.32 
 
 
344 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  55.56 
 
 
352 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  55.56 
 
 
352 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  54.71 
 
 
347 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  56.63 
 
 
345 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  56.79 
 
 
359 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  58.01 
 
 
352 aa  383  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  56.92 
 
 
362 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  56 
 
 
361 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  60.62 
 
 
343 aa  378  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  57.01 
 
 
345 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  56.67 
 
 
352 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  55.45 
 
 
342 aa  378  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  55.56 
 
 
347 aa  378  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  56.13 
 
 
376 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  54.22 
 
 
363 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  54.82 
 
 
363 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  55.12 
 
 
362 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  55.42 
 
 
390 aa  379  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>