More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1158 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1158  recombinase A  100 
 
 		 349 aa  699    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1291  recombinase A  78.51 
 
 		 357 aa  553  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0938  recombinase A  71.51 
 
 		 356 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126109  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0960  recombinase A  71.22 
 
 		 356 aa  497  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00998532  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0081  recombinase A  64.29 
 
 		 368 aa  456  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.449837  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  62.54 
 
 		 361 aa  431  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  62.54 
 
 		 424 aa  431  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  62.24 
 
 		 343 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  61.93 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  62.24 
 
 		 362 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  61.33 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  57.8 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  61.33 
 
 		 364 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  61.63 
 
 		 363 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  62.24 
 
 		 355 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  62.03 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  62.54 
 
 		 364 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  61.33 
 
 		 363 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  60.47 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  61.89 
 
 		 345 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  60.28 
 
 		 363 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  60.3 
 
 		 365 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  59.16 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  61.03 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  61.89 
 
 		 345 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  59.82 
 
 		 350 aa  421  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  60.54 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  59.94 
 
 		 358 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  59.29 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  61.03 
 
 		 363 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  61.54 
 
 		 360 aa  421  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  60.42 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  60.06 
 
 		 343 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  61.03 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  59.12 
 
 		 348 aa  418  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  59.01 
 
 		 341 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  60.12 
 
 		 379 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  59.4 
 
 		 366 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  58.58 
 
 		 357 aa  418  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  56.98 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  60.24 
 
 		 358 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  61.03 
 
 		 362 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  59.88 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  60.35 
 
 		 346 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  60.24 
 
 		 358 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  57.88 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  57.93 
 
 		 364 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  61.08 
 
 		 359 aa  418  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  58.91 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  60.83 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  60.74 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  60 
 
 		 343 aa  415  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  60 
 
 		 343 aa  415  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  60.61 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  60.3 
 
 		 350 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  59.12 
 
 		 345 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  59.52 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  58.46 
 
 		 364 aa  417  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  58.46 
 
 		 378 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  59.82 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  61.31 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  58.93 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  59.52 
 
 		 366 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  58.93 
 
 		 376 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  60 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  60 
 
 		 347 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  61.66 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  61.21 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  60.06 
 
 		 341 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  59.46 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  60.73 
 
 		 343 aa  411  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  58.72 
 
 		 336 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  60.3 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002519  RecA protein  59.64 
 
 		 347 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  60.3 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  60.3 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  60.3 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  59.09 
 
 		 383 aa  411  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  60.3 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03513  recombinase A  58.19 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  60.3 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  60.3 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  60.19 
 
 		 344 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  60.67 
 
 		 357 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  60 
 
 		 387 aa  413  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  59.82 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  57.99 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  59.7 
 
 		 347 aa  411  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  60.78 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  59.16 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  59.46 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  60 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  61.56 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  58.91 
 
 		 345 aa  408  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  58.73 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  60.31 
 
 		 365 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1287  recombinase A  59.94 
 
 		 343 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.569427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  60.18 
 
 		 366 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  59.7 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  59.64 
 
 		 368 aa  408  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>