More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0081 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0081  recombinase A  100 
 
 		 368 aa  741    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.449837  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1291  recombinase A  63.64 
 
 		 357 aa  463  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0938  recombinase A  63.1 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126109  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1158  recombinase A  64.29 
 
 		 349 aa  456  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0960  recombinase A  62.69 
 
 		 356 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00998532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  60 
 
 		 343 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  58.46 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  58.33 
 
 		 356 aa  408  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  60.86 
 
 		 355 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  59.09 
 
 		 364 aa  404  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  62.22 
 
 		 338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  62.22 
 
 		 338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  57.7 
 
 		 341 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  58.18 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  57.14 
 
 		 365 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  56.4 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  54.2 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  56.68 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  59.21 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  57.32 
 
 		 352 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  59.45 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  59.21 
 
 		 358 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  55.65 
 
 		 364 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  57.62 
 
 		 350 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  57.85 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  57.32 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  57.4 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  56.81 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  55.94 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  55.89 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  56.2 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  59.21 
 
 		 358 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  55.09 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  57.23 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  56.08 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  55.36 
 
 		 363 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  55.36 
 
 		 362 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  55.89 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  55.46 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  59.21 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  57.66 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  57.66 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  57.36 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  55.89 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  55.89 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  55.79 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  56.46 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  55.79 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  58.31 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  55.32 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  55.23 
 
 		 347 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  57.27 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  55.26 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  55.49 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  55.33 
 
 		 347 aa  391  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  55.23 
 
 		 347 aa  393  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  55.56 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  56.56 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  55.49 
 
 		 383 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  56.31 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  56.23 
 
 		 376 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  54.08 
 
 		 357 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  54.97 
 
 		 364 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  55.56 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  56.4 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  54.68 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  56.1 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  59.21 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  56.56 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  56.84 
 
 		 348 aa  388  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  58.84 
 
 		 358 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  58.51 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  57.36 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  57.36 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  58.54 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  56.02 
 
 		 355 aa  391  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  58.23 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  52.91 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  58.73 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  58.23 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3750  recA protein  55.45 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.79987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  55.18 
 
 		 347 aa  388  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  58.54 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  56.93 
 
 		 359 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  55.79 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  58.54 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  61.83 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  56.93 
 
 		 359 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  61.37 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  56.4 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  57.14 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  59.63 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  56.89 
 
 		 356 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  53.28 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  56.89 
 
 		 356 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  57.27 
 
 		 346 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  56.27 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  59.33 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  55.66 
 
 		 361 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  54.44 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>