More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0400 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  100 
 
 		 387 aa  769    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  76.58 
 
 		 379 aa  541  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  75.49 
 
 		 379 aa  530  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  65.62 
 
 		 362 aa  472  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  62.7 
 
 		 385 aa  460  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  65 
 
 		 347 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  65 
 
 		 347 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  65.14 
 
 		 376 aa  453  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  67.48 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  66.47 
 
 		 343 aa  448  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  66.57 
 
 		 343 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  66.18 
 
 		 343 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  67.66 
 
 		 343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  66.18 
 
 		 343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  65.89 
 
 		 343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  64.55 
 
 		 349 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  67.28 
 
 		 355 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  64.09 
 
 		 344 aa  438  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  63.33 
 
 		 365 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  64.13 
 
 		 366 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  60.29 
 
 		 357 aa  436  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  65.23 
 
 		 347 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  63.22 
 
 		 378 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  63.22 
 
 		 350 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  65.23 
 
 		 343 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  62.12 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  64.13 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  63.22 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  61.18 
 
 		 350 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  64.13 
 
 		 341 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  60.62 
 
 		 364 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  62.92 
 
 		 350 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  61.16 
 
 		 350 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  63.78 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  61.82 
 
 		 376 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  62.01 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  62.61 
 
 		 383 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  58.64 
 
 		 357 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  61.4 
 
 		 352 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  61.9 
 
 		 357 aa  428  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  60.81 
 
 		 352 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  60.52 
 
 		 352 aa  424  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  63.78 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  65.14 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  63.53 
 
 		 345 aa  425  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  62.24 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  57.8 
 
 		 350 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  62.42 
 
 		 358 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  61.4 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  61.31 
 
 		 345 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  61.03 
 
 		 346 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  60.64 
 
 		 349 aa  418  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  59.3 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  61.7 
 
 		 368 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  60.18 
 
 		 351 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  56.4 
 
 		 379 aa  419  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  62.96 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  60.48 
 
 		 364 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  62.96 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  61.03 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  60.3 
 
 		 367 aa  420  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  58.07 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  62.96 
 
 		 347 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1158  recombinase A  59.71 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  66.67 
 
 		 349 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  61.4 
 
 		 350 aa  415  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  63.89 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  62.12 
 
 		 348 aa  414  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  60.84 
 
 		 348 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  61.21 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  60.19 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  58.6 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  57.97 
 
 		 343 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  58.36 
 
 		 363 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  58.48 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  61.42 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  58.65 
 
 		 363 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  59.24 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  58.48 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  59.82 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  57.77 
 
 		 364 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  59.7 
 
 		 356 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  57.56 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  60.12 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  61.18 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  58.56 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  59.51 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  58.48 
 
 		 343 aa  408  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  57.47 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  58.38 
 
 		 355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_002950  PG0881  recombinase A  60.37 
 
 		 340 aa  408  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  59.64 
 
 		 361 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  60.29 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  58.86 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  60.73 
 
 		 379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  60.06 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  60.29 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  59.46 
 
 		 359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3138  recombinase A  60.29 
 
 		 353 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  59.42 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>