More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0637 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 329 aa  668    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  73.62 
 
 		 327 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  74.23 
 
 		 407 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  72.17 
 
 		 325 aa  501  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  74.47 
 
 		 324 aa  487  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  62.39 
 
 		 325 aa  418  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  61.96 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  59.63 
 
 		 324 aa  388  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  62.11 
 
 		 322 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  53.51 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  55.29 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  53.22 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  53.22 
 
 		 343 aa  381  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  52.91 
 
 		 349 aa  373  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  47.68 
 
 		 330 aa  308  8e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  47.37 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  47.06 
 
 		 333 aa  305  6e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  46.44 
 
 		 332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  48.92 
 
 		 358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  48.14 
 
 		 324 aa  296  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  46.95 
 
 		 388 aa  288  6e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  45.34 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  45.78 
 
 		 322 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  48.8 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  47.59 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  47.73 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  45.23 
 
 		 358 aa  276  4e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  47.73 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  41.61 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  41.18 
 
 		 343 aa  231  9e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  40.18 
 
 		 350 aa  226  3e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  38.11 
 
 		 658 aa  225  9e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  39.1 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  39.58 
 
 		 365 aa  210  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  33.33 
 
 		 358 aa  205  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  36.76 
 
 		 315 aa  178  9e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  30.4 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  36.72 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  28.99 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  31.95 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  29.54 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  28.9 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  27.08 
 
 		 225 aa  89.4  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  29.6 
 
 		 227 aa  89.4  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  31.47 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  31.28 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  28.33 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  28.46 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  31.45 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  26.57 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  31.12 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  26.11 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  28.45 
 
 		 235 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  31.25 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  26.78 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  29.25 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  29.96 
 
 		 234 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  24.58 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  26.7 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  28.7 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  27.49 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  26.21 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  27.36 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0455  recombinase A  26.89 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0471  recombinase A  26.89 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  30.66 
 
 		 554 aa  62.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  27.49 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  26.13 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  26.13 
 
 		 216 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0551  recombinase A  26.7 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0355  recA protein  25.47 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  27.49 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0075  recombinase A  25.47 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  25.73 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  27.18 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  25.78 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  26.57 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1392  recombinase A  25.6 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  26.67 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  25.73 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  27.01 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  27.18 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  27.01 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4152  recombinase A  25.47 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  25.94 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  26.21 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  26.7 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3351  recA protein  25.47 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4001  recA protein  25.47 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.627229  normal  0.688491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  26.32 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0497  recombinase A  25.11 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00187604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  26.21 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  27.01 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  26.21 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  26.7 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  30.43 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  26.54 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  25.73 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>