More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0491 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  100 
 
 		 227 aa  461  1e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  45.5 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  44.8 
 
 		 243 aa  189  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  43.05 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  38.39 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  39.65 
 
 		 235 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  38.33 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  39.37 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  39.46 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  35.47 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  40.69 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  36.94 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  35.24 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  37.22 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  39.72 
 
 		 215 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  36.87 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  36.92 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  36.45 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  35.98 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  33.19 
 
 		 324 aa  108  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  34.62 
 
 		 332 aa  107  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  34.75 
 
 		 358 aa  107  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  34.19 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  34.51 
 
 		 324 aa  106  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  34.43 
 
 		 322 aa  105  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  34.19 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  34.19 
 
 		 330 aa  104  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  33.05 
 
 		 358 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  34.8 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  31.47 
 
 		 325 aa  94.4  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  31.98 
 
 		 325 aa  94.4  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  31.78 
 
 		 325 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  30.54 
 
 		 350 aa  92.4  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  32.74 
 
 		 323 aa  92  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  30.71 
 
 		 407 aa  92  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  30.17 
 
 		 348 aa  91.7  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  30.89 
 
 		 327 aa  89.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  29.6 
 
 		 329 aa  89.4  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  30.13 
 
 		 388 aa  87  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  30.2 
 
 		 324 aa  87.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  29.49 
 
 		 315 aa  86.3  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  29.1 
 
 		 322 aa  85.5  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  30.8 
 
 		 343 aa  85.1  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  29 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  32.54 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  29 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  29.13 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  29.92 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  29.73 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  29.06 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  30.77 
 
 		 658 aa  79.7  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  30.63 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  28.86 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  26.27 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.72 
 
 		 363 aa  71.6  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  32.16 
 
 		 554 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  30.27 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  26.79 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  28.14 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  23.23 
 
 		 358 aa  62  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  30.05 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  29.94 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0081  recombinase A  32.35 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.449837  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  28 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17589  predicted protein  33.04 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0328752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  28.71 
 
 		 343 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  28.71 
 
 		 343 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  27.66 
 
 		 363 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  28.71 
 
 		 343 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2432  DnaB domain protein helicase domain protein  23.62 
 
 		 431 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4152  recombinase A  28.43 
 
 		 343 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  27.66 
 
 		 363 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  30 
 
 		 311 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  26.92 
 
 		 358 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  28.86 
 
 		 339 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  27.31 
 
 		 448 aa  52.4  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  27.66 
 
 		 363 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  27.23 
 
 		 346 aa  52.4  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  27.85 
 
 		 364 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  25 
 
 		 384 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  25.25 
 
 		 377 aa  52  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0497  recombinase A  25.76 
 
 		 353 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00187604 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  27.54 
 
 		 446 aa  52  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  28.82 
 
 		 344 aa  52  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  27.86 
 
 		 340 aa  52  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0887  recombinase A  26.94 
 
 		 357 aa  52  0.000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  27.06 
 
 		 450 aa  52  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1212  DNA repair protein RadA  23.65 
 
 		 449 aa  51.6  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.563327  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  33.6 
 
 		 376 aa  51.6  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0075  recombinase A  25.76 
 
 		 357 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5195  recA protein  24.75 
 
 		 375 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1109  recombinase A  27.8 
 
 		 357 aa  51.2  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  29.52 
 
 		 358 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  29.76 
 
 		 353 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3750  recA protein  24.88 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.79987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  29.36 
 
 		 352 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  29.36 
 
 		 352 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  25.25 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1291  recombinase A  29.56 
 
 		 357 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>