More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01780 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  100 
 
 		 323 aa  665    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  58.41 
 
 		 658 aa  375  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  49.84 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  50.64 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  52.09 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  51.45 
 
 		 348 aa  305  9.000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  49.54 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  43.18 
 
 		 358 aa  246  3e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  43 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  43 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  43.32 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  42.02 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  39.94 
 
 		 324 aa  239  6.999999999999999e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  42.21 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  39.61 
 
 		 358 aa  235  8e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  41.16 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  41.38 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  40.98 
 
 		 407 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  42.44 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  40.26 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  38.17 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  41.56 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  39.1 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  38.51 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  38.12 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  38.51 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  38.19 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  37.86 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  38.19 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  37.22 
 
 		 324 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  38.52 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  39.02 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  36.86 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  38.71 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  38.93 
 
 		 343 aa  188  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  37.99 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  35.8 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  34.94 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  29.19 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  31.32 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  36.32 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  32.75 
 
 		 227 aa  93.6  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.5 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  31.05 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  29.28 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  32.77 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  29.33 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  28.69 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  28.16 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  28.75 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  25.93 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  30 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  30.09 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  27.35 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  26.94 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  31.07 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  26.48 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  28.38 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  25.11 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  27.47 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2398  recA protein  26.09 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.38659e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  27.43 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  25.45 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  29.5 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  29.57 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  27.62 
 
 		 541 aa  63.2  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  26.34 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  25.85 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0206  recA protein  27.8 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.613588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1046  recombinase A  27.8 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.558521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3340  recombinase A  27.8 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  27.12 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  27.78 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1125  recombinase A  27.78 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1196  recombinase A  27.78 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3174  recombinase A  27.27 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0591186  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02549  recombinase A  27.27 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0990  recA protein  27.27 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000616835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0981  recA protein  27.73 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  25.86 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2835  recombinase A  27.27 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1300  recombinase A  27.35 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  27.27 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  27.27 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3126  recombinase A  27.35 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1208  recombinase A  27.35 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1248  recombinase A  27.35 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3946  recombinase A  27.27 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44116  normal  0.835205 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3178  recombinase A  27.27 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0943419  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1062  recombinase A  27.35 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02514  hypothetical protein  27.27 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3269  recombinase A  27.35 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  27.35 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1126  recombinase A  27.8 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2983  recombinase A  27.27 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0313902  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1215  recombinase A  27.8 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3117  recombinase A  27.35 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3240  recombinase A  27.8 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.245303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>