More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1017 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 358 aa  727    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  62.93 
 
 		 358 aa  451  1.0000000000000001e-126  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  63.67 
 
 		 332 aa  436  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  63.02 
 
 		 333 aa  434  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  60.55 
 
 		 330 aa  432  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  62.11 
 
 		 330 aa  432  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  51.58 
 
 		 388 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  53.4 
 
 		 324 aa  322  7e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  50 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  48.41 
 
 		 324 aa  308  9e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  48.61 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  49.38 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  48.77 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  47.66 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  50.16 
 
 		 322 aa  297  2e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  45.72 
 
 		 343 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  46.86 
 
 		 407 aa  279  7e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  45.23 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  44.64 
 
 		 349 aa  275  9e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  44.67 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  46.56 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  46.25 
 
 		 324 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  43.03 
 
 		 348 aa  262  6e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  43.64 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  42.61 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  44.38 
 
 		 322 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  43.97 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  43.44 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  43.75 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  43.75 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  42.86 
 
 		 658 aa  248  9e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  43.79 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  38.14 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  42.99 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  56.65 
 
 		 250 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  41.67 
 
 		 365 aa  225  9e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  38.31 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  34.84 
 
 		 307 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  33.33 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  35.56 
 
 		 314 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  30.93 
 
 		 358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  30 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  35.17 
 
 		 221 aa  113  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  35.19 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  35.19 
 
 		 227 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  33.47 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  32.05 
 
 		 227 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  33.33 
 
 		 235 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  29.07 
 
 		 351 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  31.67 
 
 		 235 aa  93.2  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  30.97 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  32.77 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  32.22 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  29.2 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  32.49 
 
 		 235 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  29.71 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  34.52 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  27.14 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  28.32 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  28.39 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  29.47 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  29.44 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  24.71 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  29.86 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  27.47 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  28.02 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  27.8 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  26.34 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0090  recombinase A  28.31 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.999196  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  26.72 
 
 		 213 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  27.01 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  28.63 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  27.8 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  29.33 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  29.26 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  28.37 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  25.58 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  28.17 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  29.33 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  28.37 
 
 		 364 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  28.37 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  28.85 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  28.37 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  25.46 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  25 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17441  recombinase A  25.46 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  24.88 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  24.88 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  27.36 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  27.73 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  30.95 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  24.43 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  27.1 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  26.76 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  24.43 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  27.1 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2695  recombinase A  24.07 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.611822  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  27.1 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>