More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0009 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 324 aa  658    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  79.63 
 
 		 324 aa  556  1e-157  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  53.38 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  51.78 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  49.69 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  51.46 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  49.38 
 
 		 325 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  51.45 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  51.13 
 
 		 330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  51.13 
 
 		 333 aa  318  9e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  50.31 
 
 		 322 aa  315  6e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  46.84 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  48.41 
 
 		 358 aa  308  9e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  46.95 
 
 		 407 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  46.54 
 
 		 327 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  48.14 
 
 		 329 aa  296  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  43.44 
 
 		 348 aa  292  5e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  43.6 
 
 		 349 aa  288  9e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  42.86 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  43.84 
 
 		 343 aa  285  5e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  43.54 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  47.91 
 
 		 388 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  44.94 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  44.65 
 
 		 322 aa  275  8e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  44.34 
 
 		 322 aa  275  8e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  43.99 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  46.69 
 
 		 324 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  42.63 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  41.14 
 
 		 348 aa  248  7e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  41.23 
 
 		 350 aa  245  9e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  39.29 
 
 		 323 aa  235  9e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  40 
 
 		 658 aa  229  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  39.35 
 
 		 343 aa  225  7e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  40.67 
 
 		 365 aa  225  9e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  37.5 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  37.08 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  39.75 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  30.18 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  31.17 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  30.67 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  29.69 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  35.74 
 
 		 224 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  34.73 
 
 		 224 aa  109  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  33.19 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  33.47 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  37.62 
 
 		 554 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  33.33 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  32.35 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  30.21 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  31.95 
 
 		 235 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  34.3 
 
 		 226 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  31.22 
 
 		 234 aa  98.2  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  31.49 
 
 		 221 aa  97.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  32.63 
 
 		 224 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  28.63 
 
 		 363 aa  97.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  31.28 
 
 		 235 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  26.98 
 
 		 275 aa  89.4  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  26.52 
 
 		 351 aa  86.3  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  30.77 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  31.6 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  30.57 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  30.74 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  30.57 
 
 		 213 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  27.96 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  27.44 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  27.65 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0090  recombinase A  27.59 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.999196  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  27.31 
 
 		 345 aa  67  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  27.8 
 
 		 541 aa  66.6  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  26.86 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  28.82 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  25.64 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  26.86 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4152  recombinase A  26.67 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  27.62 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  27.62 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  27.62 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  27.62 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  27.62 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  27.27 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  28.11 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  27.27 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  27.27 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  27.27 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  27.27 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  27.27 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  27.27 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  27.27 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  25.69 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  27.36 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  27.27 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  28.11 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  27.83 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  25.12 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  27.14 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0075  recombinase A  27.75 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1488  recombination protein RecA  27.83 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  25.84 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>