124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1396 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  638    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  78.64 
 
 		 314 aa  506  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  78.21 
 
 		 312 aa  501  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  73.48 
 
 		 311 aa  485  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  74.42 
 
 		 307 aa  474  1e-133  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  41.46 
 
 		 315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  34.62 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  34.82 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  33.44 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  35.53 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  34.39 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  35.03 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  34.39 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  34.17 
 
 		 388 aa  142  9e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  30.86 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  33.01 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  32.41 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  29.57 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  32.19 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  32.14 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  29.72 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  30.56 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  30.84 
 
 		 350 aa  122  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  31.38 
 
 		 407 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  32.81 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  31.58 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  30.34 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  27.85 
 
 		 658 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  28.96 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  31.61 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  30.77 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  30.12 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  30.34 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  30.12 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  30.4 
 
 		 349 aa  108  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  28.57 
 
 		 322 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  29.15 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  34.38 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  29.45 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  28.36 
 
 		 343 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  30.79 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  29.56 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  30.24 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  29.1 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  26.72 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  29.07 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  31.34 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  29.28 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  23.44 
 
 		 225 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.6 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  23.44 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  28.02 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  28.64 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  27.71 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  26.32 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  27.92 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  26.86 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  25.71 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  27.13 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  25.14 
 
 		 215 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  26.48 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06728  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 		 366 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  25.14 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03513  recombinase A  26.51 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002519  RecA protein  26.51 
 
 		 347 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0070  recombinase A  26.05 
 
 		 354 aa  49.3  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  25.96 
 
 		 418 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  26.56 
 
 		 554 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_002978  WD1050  recombinase A  23.58 
 
 		 355 aa  46.6  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1062  recombinase A  25.12 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3240  recombinase A  25.24 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.245303  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0901  recombinase A  25.24 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.741416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3375  recombinase A  25.24 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.376283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0996  recA protein  25.35 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3213  recombinase A  24.65 
 
 		 357 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.996939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0981  recA protein  25.35 
 
 		 358 aa  46.2  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0841  recombinase A  25.24 
 
 		 353 aa  46.2  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0280148  unclonable  0.0000000182986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1114  recombinase A  24.65 
 
 		 357 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  24.65 
 
 		 357 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  26.87 
 
 		 235 aa  46.2  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3269  recombinase A  24.65 
 
 		 355 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3117  recombinase A  24.65 
 
 		 355 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3126  recombinase A  24.65 
 
 		 355 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1248  recombinase A  24.65 
 
 		 355 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02549  recombinase A  25.94 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02514  hypothetical protein  25.94 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3430  recombinase A  24.19 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  25.78 
 
 		 360 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1125  recombinase A  24.19 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1196  recombinase A  24.19 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1126  recombinase A  24.19 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1013  recombinase A  25.94 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.580458  unclonable  0.0000000301114 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2822  recombinase A  25.94 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0783343  decreased coverage  0.0000036093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3340  recombinase A  24.65 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3178  recombinase A  25.94 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0943419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3031  recombinase A  25.94 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00473022  hitchhiker  0.000967818 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3015  recombinase A  25.94 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  decreased coverage  0.0000000499102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2980  recombinase A  25.94 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200628  decreased coverage  0.0000974758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2948  recombinase A  25.94 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3138  recombinase A  25.94 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>