137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0211 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  92.13 
 
 		 343 aa  652    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 343 aa  699    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  80.47 
 
 		 343 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  77.03 
 
 		 349 aa  540  9.999999999999999e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  75.8 
 
 		 348 aa  528  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  60.59 
 
 		 325 aa  425  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  59.71 
 
 		 325 aa  421  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  57.4 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  57.4 
 
 		 325 aa  404  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  62.5 
 
 		 322 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  56.97 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  56.25 
 
 		 324 aa  386  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  53.22 
 
 		 329 aa  381  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  56.43 
 
 		 324 aa  378  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  43.84 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  44.44 
 
 		 333 aa  286  5e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  43.54 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  44.44 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  44.44 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  42.2 
 
 		 322 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  44.15 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  45.83 
 
 		 358 aa  280  4e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  42.61 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  41.91 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  42.32 
 
 		 322 aa  275  7e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  42.52 
 
 		 358 aa  271  9e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  42.35 
 
 		 388 aa  269  5e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  41.04 
 
 		 322 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  34.01 
 
 		 348 aa  203  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  36.01 
 
 		 658 aa  196  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  36.14 
 
 		 350 aa  196  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  35.94 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  38.57 
 
 		 323 aa  186  7e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  33.82 
 
 		 358 aa  185  9e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  34.29 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  32.28 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  28.11 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  34.41 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  27.73 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  26.09 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  27.35 
 
 		 307 aa  93.2  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  27.33 
 
 		 314 aa  89.4  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  29.73 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  26.95 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  28.35 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  28.26 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  28.74 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  28.63 
 
 		 227 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  28.02 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  26.17 
 
 		 221 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  29.33 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  27.08 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  26.75 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  25.58 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  23.86 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  26.09 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  25.94 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  24.45 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  26.56 
 
 		 224 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  25.11 
 
 		 541 aa  53.5  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  24.24 
 
 		 216 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  27.19 
 
 		 226 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  22.94 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  27.83 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  23.11 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  26.64 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  22.65 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  22.51 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  26.01 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  42.86 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  24.2 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  31.11 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  27.85 
 
 		 384 aa  46.6  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  21.78 
 
 		 364 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  25.56 
 
 		 338 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  25 
 
 		 598 aa  46.6  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5195  recA protein  28.7 
 
 		 375 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  26.99 
 
 		 377 aa  46.2  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0455  recombinase A  24.89 
 
 		 352 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 463 aa  46.2  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0471  recombinase A  24.89 
 
 		 352 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10322  Rad51 family DNA repair protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14460)  25.2 
 
 		 422 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.177234 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  26.03 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  25.54 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  23.74 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  26.03 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  26.03 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  24.66 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  23.74 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  24.15 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0551  recombinase A  23.91 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  24.11 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0090  recombinase A  23.14 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.999196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  25.54 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4640  recA protein  25.65 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  24.55 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0497  recombinase A  26.03 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00187604 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0348  recombinase A  25.11 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>