More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2158 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  74.17 
 
 		 275 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  68.26 
 
 		 235 aa  321  5e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  68.4 
 
 		 227 aa  311  6.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  68.72 
 
 		 235 aa  295  5e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  42.67 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  41.96 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  41.3 
 
 		 224 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  40.62 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  41.7 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  39.65 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  38.29 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  38.22 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  36.49 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  36.16 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  34.67 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  33.19 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  34.56 
 
 		 213 aa  134  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  31.34 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  32.79 
 
 		 324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  31.95 
 
 		 324 aa  102  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  33.8 
 
 		 350 aa  98.6  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  33.61 
 
 		 343 aa  97.4  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  34.33 
 
 		 330 aa  97.1  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  34.33 
 
 		 333 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  33.91 
 
 		 332 aa  96.7  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  33.91 
 
 		 330 aa  95.5  7e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  31.67 
 
 		 358 aa  93.2  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  27.2 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  28.02 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  28.22 
 
 		 358 aa  81.6  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  32.38 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  28.98 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  29.1 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  29.71 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  27.63 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  28.35 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  28.51 
 
 		 325 aa  79  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  29.67 
 
 		 348 aa  78.6  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  28.57 
 
 		 322 aa  78.6  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  27.23 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  27.13 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  29.61 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  28.69 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1816  recA protein  30.26 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  26.05 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  26.07 
 
 		 325 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  29.91 
 
 		 324 aa  75.5  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  28.69 
 
 		 322 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  28.69 
 
 		 322 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  28.57 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  26.45 
 
 		 658 aa  72  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  25.59 
 
 		 343 aa  71.6  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  25.32 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0876  recombinase A  27.14 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  28.22 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  29.3 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  26.45 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  28.5 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  28.78 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  28.21 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  26.38 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  27.94 
 
 		 338 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  29.35 
 
 		 369 aa  68.9  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  27.08 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  27.78 
 
 		 357 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  28.82 
 
 		 337 aa  68.6  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  28.17 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0355  recA protein  29.27 
 
 		 367 aa  68.6  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54013  chloroplast-targeted nuclear-encoded recombinase  31.1 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.481805  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  26.83 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  26.83 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0310  recombinase A  27.73 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  28.92 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  28.44 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  26.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  28.44 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  26.76 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  28.02 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  27.96 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  28.29 
 
 		 343 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  28.29 
 
 		 343 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2629  recA protein  28 
 
 		 366 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  27.59 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0296  recA protein  25.24 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.197187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  26.67 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  26.67 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  28.29 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  27.39 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  27.32 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0086  recombinase A  28.57 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1476  recombinase A  29.06 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158308  normal  0.357343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0219  recombinase A  26.82 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  27.69 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  26.84 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0100  recombinase A  28.08 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  24.69 
 
 		 347 aa  65.5  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  26.5 
 
 		 345 aa  65.5  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  28.29 
 
 		 358 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  24.58 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>