More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1640 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  100 
 
 		 215 aa  421  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  93.46 
 
 		 215 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  92.56 
 
 		 216 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  77.25 
 
 		 213 aa  327  9e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  58.77 
 
 		 213 aa  263  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  45.75 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  42.25 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  36.49 
 
 		 235 aa  148  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  36.15 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  35.78 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  36.82 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  35.65 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  37.26 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  37.09 
 
 		 224 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  34.11 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  34.86 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  39.72 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  30.74 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  34.55 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  30.4 
 
 		 333 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  29.52 
 
 		 332 aa  92.8  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  29.96 
 
 		 330 aa  90.9  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  29.52 
 
 		 330 aa  89.7  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  33.04 
 
 		 358 aa  85.5  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  30.97 
 
 		 358 aa  85.1  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  30.57 
 
 		 324 aa  74.7  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  28.79 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  26.64 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  28.99 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  31.63 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  24.49 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  28.99 
 
 		 322 aa  68.6  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  26.48 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  28.99 
 
 		 322 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  27.23 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  27.97 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  27.97 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  27.88 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  27.03 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  29.07 
 
 		 388 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  28.71 
 
 		 658 aa  64.7  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  24.86 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  27.57 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  26.09 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1352  recA protein  25.6 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl206  recombinase A  27.32 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1488  recombination protein RecA  26.09 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  26.64 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  24.06 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  23.24 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  26.13 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  27.1 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  26.73 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  26.64 
 
 		 325 aa  61.6  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  24.46 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  27.2 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  30.29 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  25.73 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  22.6 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  25.41 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2553  recA protein  26.5 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159054  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  25.12 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  24.86 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  23.67 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  22.7 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  27.19 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  27 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  23.67 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  23.67 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  24.32 
 
 		 346 aa  58.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  24.52 
 
 		 346 aa  58.5  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0090  recombinase A  25.42 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.999196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  24.64 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  25 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  24.86 
 
 		 352 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  28.9 
 
 		 314 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  24.39 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  23.53 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  23.19 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0033  RecA protein  26.32 
 
 		 358 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1658  recA protein  21.81 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000206716  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  24.26 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  28.38 
 
 		 492 aa  55.8  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  22.46 
 
 		 383 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1050  recombinase A  24.15 
 
 		 355 aa  55.5  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  25.95 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  27.37 
 
 		 554 aa  55.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  28.57 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  24.22 
 
 		 456 aa  55.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  23.94 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  21.62 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  21.62 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  22.49 
 
 		 361 aa  55.1  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1685  DNA repair protein RadA  23.04 
 
 		 466 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  23.19 
 
 		 379 aa  54.7  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 312 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  22.4 
 
 		 351 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0887  recombinase A  24.47 
 
 		 357 aa  54.7  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  22.12 
 
 		 351 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1109  recombinase A  24.46 
 
 		 357 aa  54.7  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>