More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0285 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  60.09 
 
 		 213 aa  266  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  58.77 
 
 		 215 aa  263  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  57.82 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  56.87 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  38.79 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  39.53 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  37.96 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  35.78 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  36.7 
 
 		 224 aa  131  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  31.92 
 
 		 227 aa  128  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  31.34 
 
 		 235 aa  127  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  34.88 
 
 		 224 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  34.56 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  36.87 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  35.05 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  33.33 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  26.85 
 
 		 275 aa  109  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  33.18 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  30.57 
 
 		 324 aa  72  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1488  recombination protein RecA  28.17 
 
 		 337 aa  71.6  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  28.17 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1352  recA protein  27.7 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  28.3 
 
 		 357 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  26.67 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  24.79 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0291  recombinase A  27.36 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000893894  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  27.92 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  27.88 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  26.67 
 
 		 351 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  27.43 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  25.67 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  28.08 
 
 		 358 aa  65.5  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  27.88 
 
 		 330 aa  65.1  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  28.78 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  26.99 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2553  recA protein  26.09 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1255  hypothetical protein  26.32 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000979449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  25.36 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  25.24 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3750  recA protein  25.81 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.79987  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  28.86 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  25 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  27.01 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  22.75 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  25.94 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0874  recA protein  25.67 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532648 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  35.04 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  29.23 
 
 		 324 aa  62  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  23.53 
 
 		 346 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  23.44 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  25.27 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  24.4 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3617  recA protein  24.54 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0876  recombinase A  25.94 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2398  recA protein  27.37 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.38659e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  24.76 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1816  recA protein  24.88 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0355  recA protein  24.6 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  24.29 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  25.36 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  24.64 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl206  recombinase A  25.13 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3687  recA protein  24.88 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  25.47 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  25.47 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  26.07 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  23.92 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  25.36 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  25.47 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  24.64 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  22.46 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12750  DNA recombination protein RecA  22.01 
 
 		 790 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000250397  normal  0.0414269 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  26.54 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  23.94 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3948  recA protein  25.67 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  25.36 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  25.35 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3756  recA protein  24.42 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  26.5 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  22.75 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  25.24 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  26.6 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  24.64 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  24.64 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  26.55 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4152  recombinase A  25.13 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2185  recombinase A  24.06 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019841  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  25.84 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  23.22 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  24.17 
 
 		 355 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  25 
 
 		 414 aa  58.9  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  22.97 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  25.24 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  27.36 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  24.76 
 
 		 376 aa  58.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  26.06 
 
 		 343 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1658  recA protein  23.36 
 
 		 377 aa  58.5  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000206716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  25.84 
 
 		 379 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>