More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl206 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl206  recombinase A  100 
 
 
346 aa  687    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0551  recombinase A  62.88 
 
 
328 aa  411  1e-114  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.99148  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  59.68 
 
 
347 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  54.78 
 
 
362 aa  381  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  56.27 
 
 
336 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf179  recombinase A  57.19 
 
 
334 aa  380  1e-104  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  56.21 
 
 
343 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  56.21 
 
 
347 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  54.27 
 
 
357 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  54.69 
 
 
347 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  56.21 
 
 
347 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  54.32 
 
 
348 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  54.66 
 
 
347 aa  372  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  55 
 
 
347 aa  371  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  54.32 
 
 
348 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  53.87 
 
 
355 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  55.14 
 
 
348 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  53.8 
 
 
361 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  57.05 
 
 
364 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  52.74 
 
 
350 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  52.37 
 
 
362 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  52.96 
 
 
363 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  54.37 
 
 
343 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  52.96 
 
 
363 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  55.59 
 
 
352 aa  369  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  55.76 
 
 
347 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  54.06 
 
 
365 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  54.46 
 
 
361 aa  369  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  54.83 
 
 
343 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  55.31 
 
 
349 aa  365  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  52.07 
 
 
363 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  55.59 
 
 
350 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  52.66 
 
 
364 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  52.84 
 
 
356 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  54.66 
 
 
358 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  55.14 
 
 
363 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  52.66 
 
 
362 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  54.06 
 
 
359 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  53.44 
 
 
383 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  54.66 
 
 
358 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  54.37 
 
 
345 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  54.35 
 
 
358 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  53.75 
 
 
345 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  54.29 
 
 
350 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  55.38 
 
 
337 aa  365  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  52.62 
 
 
361 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  52.37 
 
 
362 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  54.04 
 
 
358 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  54.06 
 
 
352 aa  364  1e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  52.32 
 
 
360 aa  363  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  52.81 
 
 
378 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  54.04 
 
 
341 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  52.85 
 
 
357 aa  363  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  52.71 
 
 
352 aa  363  3e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  56.77 
 
 
358 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  56.45 
 
 
358 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  54.29 
 
 
354 aa  362  4e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  52.62 
 
 
424 aa  362  4e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0988  recA protein  52.71 
 
 
335 aa  362  4e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  54.35 
 
 
345 aa  362  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  53.03 
 
 
341 aa  362  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  57.05 
 
 
376 aa  362  4e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  54.66 
 
 
379 aa  362  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  54.83 
 
 
362 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  52.5 
 
 
346 aa  362  6e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1291  recombinase A  55.05 
 
 
357 aa  362  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260339  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  54.37 
 
 
350 aa  361  8e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  52.25 
 
 
367 aa  361  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  56.13 
 
 
356 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0663  recA protein  54.31 
 
 
346 aa  360  2e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  56.13 
 
 
356 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  51.68 
 
 
368 aa  360  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  56.13 
 
 
356 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  56.13 
 
 
356 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  56.13 
 
 
356 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  56.13 
 
 
356 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  53.75 
 
 
358 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  56.13 
 
 
356 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  54.69 
 
 
349 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  53.12 
 
 
376 aa  360  3e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  53.97 
 
 
351 aa  359  3e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  52.25 
 
 
351 aa  359  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  54.21 
 
 
347 aa  360  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  53.97 
 
 
364 aa  359  4e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  53.42 
 
 
347 aa  359  4e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  52.8 
 
 
358 aa  359  5e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  55.48 
 
 
358 aa  358  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  55.81 
 
 
356 aa  358  6e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  53.09 
 
 
346 aa  358  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1303  recombinase A  54.23 
 
 
355 aa  358  6e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  53.44 
 
 
347 aa  358  6e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  51.1 
 
 
390 aa  358  6e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  54.35 
 
 
347 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  54.35 
 
 
347 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  52.81 
 
 
348 aa  358  7e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  54.35 
 
 
347 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  54.35 
 
 
350 aa  358  8e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  52.5 
 
 
345 aa  358  9e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  52.5 
 
 
345 aa  358  9e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3687  recA protein  53.97 
 
 
343 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>