More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1606 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1606  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  677    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.533727  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1352  recA protein  97.92 
 
 		 337 aa  670    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1488  recombination protein RecA  98.52 
 
 		 337 aa  672    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  67.58 
 
 		 358 aa  463  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  67.5 
 
 		 364 aa  457  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  67.91 
 
 		 341 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  66.67 
 
 		 344 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  66.67 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  66.67 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  65.12 
 
 		 351 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  66.56 
 
 		 347 aa  450  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  67.39 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  68.22 
 
 		 349 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  66.36 
 
 		 355 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  65.94 
 
 		 383 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  65.22 
 
 		 365 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  65.54 
 
 		 348 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  64.85 
 
 		 345 aa  438  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  64.8 
 
 		 378 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  64.91 
 
 		 346 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  65.42 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  63.98 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  64.17 
 
 		 350 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  64 
 
 		 343 aa  431  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  63.86 
 
 		 345 aa  431  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  63.55 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  63.55 
 
 		 347 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  63.8 
 
 		 366 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  63.55 
 
 		 350 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  64.49 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  63.55 
 
 		 350 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  62.35 
 
 		 367 aa  425  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  63.16 
 
 		 364 aa  425  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  63.8 
 
 		 352 aa  424  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  65.74 
 
 		 346 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  63.58 
 
 		 341 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  62.8 
 
 		 347 aa  424  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  63.55 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  62.93 
 
 		 350 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  63.86 
 
 		 345 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  63.55 
 
 		 376 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  63.44 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  64.38 
 
 		 368 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  62.58 
 
 		 379 aa  423  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  63.16 
 
 		 347 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  63.12 
 
 		 348 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  62.62 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  63.28 
 
 		 349 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  62.93 
 
 		 346 aa  421  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2960  recombinase A  65.05 
 
 		 353 aa  421  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0334216  hitchhiker  0.0000660744 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  61.99 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3118  recombinase A  65.05 
 
 		 353 aa  421  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163831  unclonable  0.0000179844 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  62.31 
 
 		 351 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  62.04 
 
 		 353 aa  419  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  61.42 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  61.42 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  63.52 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  62.81 
 
 		 348 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  63.16 
 
 		 357 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  62.62 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  61.54 
 
 		 418 aa  418  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  63.52 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  62.62 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  62.62 
 
 		 347 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  61.99 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  62.93 
 
 		 336 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  64.17 
 
 		 345 aa  414  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  62.54 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  62.54 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  64.82 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  63.86 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  59.64 
 
 		 347 aa  411  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  62.11 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  61.42 
 
 		 343 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  60.19 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  61.06 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  62.42 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  59.64 
 
 		 347 aa  411  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  61.96 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  61.92 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  60.75 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  61.85 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0019  recombinase A  61.42 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.112169  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  62.58 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  63.58 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  61.61 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  61.04 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  60.8 
 
 		 363 aa  408  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  61.11 
 
 		 342 aa  408  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  61.96 
 
 		 359 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  62.5 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  60.62 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  61.16 
 
 		 345 aa  408  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  61.96 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  61.96 
 
 		 358 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  62.93 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  61.96 
 
 		 359 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  61.61 
 
 		 356 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03079  recombinase A  62.04 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.353429  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  62.5 
 
 		 343 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>