More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2429 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  60.54 
 
 		 224 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  61.11 
 
 		 224 aa  284  7e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  54.17 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  56.02 
 
 		 224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  42.47 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  41.31 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  45.21 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  38.29 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  40.18 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  35.98 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  38.84 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  35.24 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  38.5 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  34.11 
 
 		 215 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  33.64 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  34.58 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  34.11 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  34.56 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  34.3 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  29.75 
 
 		 324 aa  90.1  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  31.22 
 
 		 332 aa  88.6  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  30.8 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  30.34 
 
 		 330 aa  85.1  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  32.5 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  29.54 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  31.9 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  29.11 
 
 		 315 aa  75.1  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  28.87 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  28.87 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  29.83 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  30.67 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  31.25 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  30.58 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  26.64 
 
 		 457 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  29.38 
 
 		 388 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  27.1 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  26.86 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  28.02 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  25.12 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  31.06 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  27.91 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  28.43 
 
 		 658 aa  62.4  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2458  DNA repair protein RadA  26.13 
 
 		 450 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  27.38 
 
 		 325 aa  62  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  25.5 
 
 		 484 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  30.12 
 
 		 322 aa  62  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  25.11 
 
 		 462 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  29.15 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  25.68 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  34.13 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  25.6 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1956  DNA repair protein RadA  26.96 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  34.13 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  27.23 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  25.11 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  28.22 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1922  DNA repair protein RadA  27.88 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000667281  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  27.48 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  24.77 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  27.98 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  33.53 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  27.57 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  27.54 
 
 		 459 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  27.98 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  29.63 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  23.81 
 
 		 446 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  27.39 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  30.6 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  25 
 
 		 451 aa  58.9  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4095  DNA repair protein RadA  25.55 
 
 		 452 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  27.52 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  24.38 
 
 		 453 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  28.51 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4000  DNA repair protein RadA  25.55 
 
 		 452 aa  58.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405173  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  24.38 
 
 		 453 aa  58.5  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  30.6 
 
 		 322 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0291  recombinase A  28.33 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000893894  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  24.68 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3279  DNA repair protein RadA  28.64 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  hitchhiker  0.00533763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  27.1 
 
 		 473 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  25.89 
 
 		 478 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  26.92 
 
 		 465 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  30.17 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  29.71 
 
 		 350 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1525  recA protein  31.87 
 
 		 353 aa  57  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245316  unclonable  4.38442e-19 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  28.94 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0023  DNA repair protein RadA  24.31 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0179797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  26.46 
 
 		 460 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  24.66 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  37.7 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  25.23 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  28.94 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0247  DNA repair protein RadA  24.31 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  30.05 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  24.17 
 
 		 505 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  31.2 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1787  recombinase A  29.35 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.744188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0876  recombinase A  27.16 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  24.88 
 
 		 457 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>