More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1953 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 330 aa  673    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  96.36 
 
 		 330 aa  654    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  90.96 
 
 		 332 aa  627  1e-179  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  90.39 
 
 		 333 aa  614  1e-175  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  71.75 
 
 		 358 aa  493  9.999999999999999e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  63.31 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  53.57 
 
 		 324 aa  332  7.000000000000001e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  53.07 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  51.71 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  50.16 
 
 		 325 aa  321  9.000000000000001e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  51.46 
 
 		 324 aa  321  9.999999999999999e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  50.95 
 
 		 388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  50.47 
 
 		 327 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  50.47 
 
 		 325 aa  315  8e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  47.37 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  52.34 
 
 		 322 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  47.47 
 
 		 407 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  45.51 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  44.9 
 
 		 348 aa  289  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  48.28 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  44.87 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  44.15 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  45.25 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  46.06 
 
 		 322 aa  278  9e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  44.38 
 
 		 322 aa  277  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  44.34 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  44.86 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  41.94 
 
 		 343 aa  272  5.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  43.99 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  44.87 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  43.99 
 
 		 658 aa  253  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  42.67 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  44.76 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  41.88 
 
 		 343 aa  238  8e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  44.44 
 
 		 365 aa  236  3e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  40.79 
 
 		 358 aa  229  3e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  46.12 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  36.04 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  35.26 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  35.78 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  31.12 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  35.86 
 
 		 225 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  35.5 
 
 		 243 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  34.19 
 
 		 227 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  33.19 
 
 		 221 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  34.63 
 
 		 227 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  35.32 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  33.9 
 
 		 224 aa  106  5e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  32.33 
 
 		 224 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  34.32 
 
 		 235 aa  99.8  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.12 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  30.3 
 
 		 234 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  34.33 
 
 		 235 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  28.05 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  41.99 
 
 		 554 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  30.84 
 
 		 216 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  30.4 
 
 		 215 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  29.52 
 
 		 215 aa  89.7  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  86.3  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  30.34 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  30.26 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  29.82 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  32.64 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  30.9 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0360  recA protein  28.44 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  26.29 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.98 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0090  recombinase A  27.44 
 
 		 333 aa  67  0.0000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.999196  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  28.57 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  30 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4152  recombinase A  29.72 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  27.75 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  30.2 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  27.88 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  27.43 
 
 		 213 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  29.52 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  29.52 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17441  recombinase A  29.52 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  29.52 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  26.58 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  29.05 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  28.57 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  27.24 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1133  recombinase A  28.4 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  29.81 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  30.29 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20071  recombinase A  28.4 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0551  recombinase A  28.17 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.99148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1195  recombinase A  28.34 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.111178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  29.58 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  27.91 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  29.3 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2747  recombinase A  27.94 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  29.3 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  26.29 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  27.88 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  26.57 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  27.4 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>