More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12750 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12750  DNA recombination protein RecA  100 
 
 		 790 aa  1602    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000250397  normal  0.0414269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  94 
 
 		 347 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  94 
 
 		 347 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  94 
 
 		 347 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  92.8 
 
 		 350 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  92.34 
 
 		 350 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  92 
 
 		 350 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  89.07 
 
 		 347 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  89.11 
 
 		 345 aa  445  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  89.11 
 
 		 347 aa  446  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  87.6 
 
 		 347 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  89.07 
 
 		 345 aa  442  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  86.11 
 
 		 345 aa  442  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  86.11 
 
 		 376 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  87.04 
 
 		 366 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  84.92 
 
 		 345 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  84.92 
 
 		 346 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  87.04 
 
 		 350 aa  438  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  83.07 
 
 		 348 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  84.13 
 
 		 359 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  85.43 
 
 		 367 aa  432  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  82.28 
 
 		 348 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  87.7 
 
 		 348 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  85.02 
 
 		 365 aa  432  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  83.73 
 
 		 352 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  82.94 
 
 		 352 aa  428  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  81.75 
 
 		 364 aa  427  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  85.43 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  82.73 
 
 		 383 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  83 
 
 		 368 aa  423  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  83 
 
 		 378 aa  422  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  81.35 
 
 		 351 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  81.05 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  79.37 
 
 		 349 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  82.59 
 
 		 351 aa  415  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  78.63 
 
 		 379 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3919  recA protein  83.19 
 
 		 344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  74.49 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  71.77 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  70.9 
 
 		 350 aa  382  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  72.47 
 
 		 355 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  72.29 
 
 		 341 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  70.45 
 
 		 347 aa  379  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  74.6 
 
 		 348 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  69.69 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  76.52 
 
 		 379 aa  376  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  71.77 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  72.87 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  70.45 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  71.54 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  69.64 
 
 		 341 aa  372  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  71.26 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  71.54 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  70.04 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  70.04 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  71.77 
 
 		 336 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  70.24 
 
 		 390 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  70.52 
 
 		 347 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  65.23 
 
 		 358 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  72.06 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  69.76 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  69.29 
 
 		 358 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  70.92 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  71.26 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  72.58 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  72.47 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  69.02 
 
 		 355 aa  368  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  68.9 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  72.8 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  66.03 
 
 		 357 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  69.64 
 
 		 347 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  70.85 
 
 		 360 aa  366  1e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  72.47 
 
 		 359 aa  365  1e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  69.64 
 
 		 347 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  72 
 
 		 366 aa  365  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0258  recA protein  69.6 
 
 		 361 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  67.77 
 
 		 342 aa  364  3e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3687  recA protein  69.96 
 
 		 343 aa  364  4e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  71.01 
 
 		 349 aa  363  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  72.06 
 
 		 345 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  72.06 
 
 		 345 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  71.37 
 
 		 363 aa  363  7.0000000000000005e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  69.96 
 
 		 351 aa  363  7.0000000000000005e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  72.18 
 
 		 365 aa  363  7.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  73.44 
 
 		 339 aa  363  9e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  69.44 
 
 		 354 aa  362  1e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0145  recombinase A  71.78 
 
 		 338 aa  362  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0387  recA protein  71.77 
 
 		 347 aa  362  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  69.23 
 
 		 352 aa  362  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3294  recA protein  57.8 
 
 		 729 aa  362  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.088639  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  68.42 
 
 		 347 aa  361  3e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  69.44 
 
 		 358 aa  361  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  69.35 
 
 		 348 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  69.35 
 
 		 348 aa  360  5e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3750  recA protein  69.17 
 
 		 340 aa  360  7e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.79987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  68.7 
 
 		 347 aa  360  8e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  70.16 
 
 		 347 aa  359  9e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  69.51 
 
 		 345 aa  359  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  69.51 
 
 		 354 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  68.42 
 
 		 347 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>